Η Chiesa di San Francesco ιδρύθηκε γύρω στα μέσα του '200 από τον San Francesco, ο οποίος εκείνα τα χρόνια έμεινε στη Massa Marittima για να προωθήσει το σχηματισμό ενός πρώτου πυρήνα των μοναχών του Τάγματος. Η δομή της εκκλησίας, που συνδέεται με ένα μοναστήρι, είναι εξαιρετικά απλή, σε γοτθικό στιλ με ένα ενιαίο κλίτος και καμάρες στήριξης και βρισκόταν αρχικά μέσα στα τείχη της πόλης. Το εξωτερικό χαρακτηριζόταν από μεγάλα μυτερά παράθυρα. Ο ναός έχει υποστεί πολλές ανακαινίσεις, κυρίως λόγω καθίζησης λόγω σεισμών, και ο ναός μειώθηκε το 1529 και αρκετές φορές τον XVIII και XIX αιώνα. Σήμερα, από την αρχική δομή, παραμένει μόνο ένα μέρος της αψίδας και μέρος του κυρίως ναού, ενώ στο εσωτερικό του υπάρχει ο τάφος του Bindoccio, γιου της Margherita Aldobrandeschi και του Nello Pannocchieschi (παντρεμένος σε πρώτο γάμο με την PIA Dei Tolomei). Μερικά έργα ζωγραφικής του δέκατου έβδομου αιώνα από τον Ραφαήλ Βάνι βρίσκονται κοντά στους τρεις βωμούς.
