Η Εκκλησία του San Giovanni Battista είναι ένα από τα πιο όμορφα και καλύτερα διατηρημένα παραδείγματα του ρωμανικού στυλ της Απουλίας που υπάρχει στη Matera. Η αρχική δομή χρονολογείται από χρόνια αμέσως πριν από τον δωδέκατο αιώνα και ολοκληρώθηκε το 1233, κατά την περίοδο αυτή η εκκλησία ήταν γνωστή ως Santa Maria La Nova και ήταν ένας τόπος υποδοχής για τους Αυγουστινιανούς μετανοούντες του Accon. Όταν οι μοναχές μετακόμισαν, γύρω στα τέλη του δέκατου πέμπτου αιώνα, η εκκλησία εγκαταλείφθηκε και παρέμεινε αχρησιμοποίητη μέχρι το έτος 1695 κατά το οποίο ο Monsignor Del Ryos επέβαλε την επαναλειτουργία της για να προσκυνήσει, δίνοντάς της το όνομα με το οποίο το γνωρίζουμε σήμερα. Είναι προσβάσιμο μέσω ό, τι ήταν αρχικά η πλευρική πρόσοψη, η κύρια ενσωματώθηκε το 1610 στην κατασκευή του παρακείμενου κτιρίου που επρόκειτο να εκτελέσει τη λειτουργία του Νοσοκομείου. Η λεπτή διακοσμημένη πύλη, ένα τριαντάφυλλο παράθυρο διακοσμημένο με εκλεπτυσμένα στολίδια και ένα άγαλμα του Αγίου Ιωάννη του Βαπτιστή από πολύχρωμη πέτρα ξεχωρίζουν. Στα δεξιά της πύλης η πρόσοψη που αντιστοιχεί στην αψίδα έχει δομή πολύ κοντά στην αρχική. Το στοιχείο που χαρακτηρίζει περισσότερο αυτή την εκκλησία είναι η τυπικά μεσαιωνική εσωτερική αρχιτεκτονική, είναι δυνατόν να το θαυμάσετε χάρη στην πρωτοβουλία του Ηγουμένου Marcello Morelli ο οποίος μεταξύ 1920 και 1930 αποφάσισε να εξαλείψει την κάλυψη του δέκατου όγδοου αιώνα. Η εκκλησία έχει λατινικό σταυρό και αποτελείται από 3 ναούς που χωρίζονται από τετράπλευρους πυλώνες.πάνω τους υπάρχουν ημι-κίονες και κιονόκρανα που έχουν πολύ περίτεχνα και εξαιρετικά ποικίλα διακοσμητικά στοιχεία. Από τους πυλώνες αναπτύσσονται μεγάλες καμάρες που σχηματίζουν σταυροειδείς θόλους.