Το μουσείο ιδρύθηκε τη δεκαετία του 1930 στο Παλάτι του Επισκόπου, το οποίο επιθυμούσε ο Corrado Ricci στις αρχές του 20ού αιώνα και δημιουργήθηκε χάρη στον Κανονιέρη του Καθεδρικού Ναού Maurizio Cavallini. Αναγκάστηκε να κλείσει λόγω κάποιων ζημιών που υπέστη κατά τη διάρκεια του Β' Παγκοσμίου Πολέμου, άνοιξε ξανά και έκλεισε ξανά σε εναλλασσόμενες φάσεις μέχρι το τέλος του αιώνα μπροστά στις συνεχείς και μακροχρόνιες δομικές παρεμβάσεις. Έτσι, άνοιξε ξανά τη δεκαετία του 1950, έκλεισε τη δεκαετία του 1980, άνοιξε ξανά τη δεκαετία του 1990, μέχρι να ληφθεί η λιγότερο επαχθής απόφαση να μεταφερθεί το μουσείο στην όμορφη εκκλησία του Sant'Agostino.
Το μουσείο ξαναζωντάνεψε μετά το σχέδιο διαρρύθμισης του Guicciardini & Magni Architetti, Η έκθεση παρουσιάζει έργα από τον Καθεδρικό Ναό και, σε μικρό βαθμό, από εκκλησίες της Επισκοπής- αλλά η μεγαλύτερη αξία της είναι ότι διατηρεί, εκτός από ορισμένους πίνακες ζωγραφικής, ξυλόγλυπτα και πήλινα γλυπτά, ιερά άμφια, τα μόνα σωζόμενα μαρμάρινα γλυπτά των μεγάλων μνημείων του 14ου αιώνα που ανεγέρθηκαν στον Καθεδρικό Ναό.
Κάτω από το χαγιάτι του πρεσβυτερίου υπάρχουν μερικοί κίονες του 11ου αιώνα. Κατά μήκος της σκάλας υπάρχει το υπέρθυρο της εκκλησίας S. Lorenzo a Montalbano που χρονολογείται από τον 10ο αιώνα. Η μαρμάρινη ζωφόρος με παραστάσεις χερουβείμ είναι έργο του Mino da Fiesole. Έντεκα αψίδες με τριφυλλόσχημες καμάρες και δύο μαρμάρινες στήλες, που πιθανώς ανήκουν σε αρχαία χορωδία του αβαείου του S. Giusto, φέρουν πορτρέτα ηγουμένων και αγγέλων με γοτθικές και λατινικές επιγραφές του 14ου αιώνα.
Στο μουσείο εκτίθενται έργα των: Domenico di Michelino, Rosso Fiorentino, Baldassarre Franceschini, Daniele Ricciarelli, Stefano di Antonio Vanni, Antonio del Pollaiolo, Giambologna και άλλοι.
