Η ανέγερση του Studium διατάχθηκε από τον αυτοκράτορα Φρειδερίκο Β' της Σουαβίας στις 5 Ιουνίου (5 Ιουλίου σύμφωνα με ορισμένες πηγές) του 1224 με εγκύκλιο (generalis lictera) που στάλθηκε από τις Συρακούσες. Δεδομένου ότι δημιουργήθηκε κατ' εντολή του ίδιου του αυτοκράτορα, το Πανεπιστήμιο της Νάπολης θεωρείται απολύτως το πρώτο κοσμικό πανεπιστήμιο στην Ευρώπη κρατικού τύπου (δηλαδή δεν ιδρύθηκε από συντεχνίες ή ενώσεις διανοουμένων ή φοιτητών, αλλά δυνάμει κυρίαρχου διατάγματος).Υπήρχαν δύο κύριοι λόγοι που ώθησαν τον αυτοκράτορα να οικοδομήσει το Studium: πρώτον, η αποκλειστική εκπαίδευση του διοικητικού και γραφειοκρατικού προσωπικού της curia regis (της άρχουσας τάξης του βασιλείου) και συνεπώς η προετοιμασία νομικών που θα βοηθούσαν τον ηγεμόνα στον καθορισμό του κρατικού συστήματος και στην εκτέλεση των νόμων- δεύτερον, η διευκόλυνση των υπηκόων του στην πολιτιστική τους εκπαίδευση, αποφεύγοντάς τους άχρηστα και δαπανηρά ταξίδια στο εξωτερικό.Η επιλογή της έδρας έπεσε στη Νάπολη για λόγους όχι μόνο πολιτιστικούς (η πόλη είχε μακρά παράδοση στον τομέα αυτό, που συνδέεται με τη μορφή του Βιργίλιου, ο οποίος μνημονεύεται ρητά σε έγγραφο της εποχής), αλλά και γεωγραφικούς και οικονομικούς (το θαλάσσιο εμπόριο, το ήπιο κλίμα και η στρατηγική θέση στο εσωτερικό του Βασιλείου ήταν, ως ένα βαθμό, καθοριστικά). Η οργάνωση του Studium στηρίχθηκε στο έργο δύο επιφανών νομικών από την Καμπανία: του Pier delle Vigne και του Taddeo da Sessa.