Сабор Святога Пятра быў заснаваны ў канцы 7 стагоддзя Амандусам, місіянерам, пасланым франкскімі каралямі для звароту ў хрысціянства язычніцкіх жыхароў рэгіёну, які заснаваў у гэтым раёне два манастыры: Святога Баво і Святога Пятра на Бландийнберге. Узімку 879-80 гадоў абацтва падвергнулася набегу і разрабаванню нарманаў, і яно заставалася адносна бедным да 10 стагоддзя, калі ахвяраванні маёмасці і рэліквій графа Арнульфа I значна ўзбагацілі яго, як і далейшыя ахвяраванні стрыечнага брата Арнульфа, караля Англіі Эдгара. Да другой паловы стагоддзя гэта было самае багатае абацтва ў Фляндрыі, а рэпутацыя абацкай школы распаўсюдзілася далёка за межы горада.
У 984 годзе Герберт Арыйакскі, дырэктар Кафедральнай школы Рэймса (пасля папа Сільвестр II), пацікавіўся, ці могуць вучні з Рэймса быць прыняты ў Сабор Святога Пятра, і яго слава як цэнтра свабодных мастацтваў працягвалася і ў 11 стагоддзі. Сабор Святога Пятра, дзякуючы свайму валоданню вялікімі ўчасткамі зямлі, таксама сыграў наватарскую ролю ў земляробстве ў 12-13 стагоддзях, ператварыўшы лясы, верасовыя пусткі і балоты ў сельскагаспадарчыя ўгоддзі. У 15 стагоддзі ў рамках маштабнай праграмы будаўніцтва былі створаны бібліятэка і скрыпторый абацтва, пашырана трапезная, а царква абацтва і іншыя будынкі былі значна ўпрыгожаны.
Першы заняпад Святога Пятра пачаўся пасля паўстання ў Генце ў 1539 годзе, а да 1560-м гадам Нідэрланды пагрузіліся ў рэлігійны крызіс, які прывёў да нападу іканаборцаў у 1566 годзе, у выніку якога царква абацтва была разбурана, бібліятэка разрабавана, а іншыя будынкі моцна пашкоджаны. Лазарэт быў выкарыстаны ў якасці часовага жылля для манахаў, а трапезная выкарыстоўвалася як месца пакланення. Аднак супраціў працягваўся, і ў 1578 годзе абат і манахі былі вымушаныя бегчы ў Дуэ. Будынкі абацтва былі прададзены з публічных таргоў і часткова знесены, а матэрыялы былі выкарыстаны для будаўніцтва гарадскіх сцен. Абацтва, нарэшце, вярнулася ў рукі царквы ў 1584 годзе, і ў канчатковым выніку яно было перабудавана з новай царквой абацтва, пабудаванай у 1629 годзе ў стылі барока, а таксама некалькімі іншымі новымі пабудовамі і рэканструкцыямі. У 18 стагоддзі абацтва зноў квітнела, так як былі пабудаваныя новыя будынкі і пашыраны старыя, у тым ліку было пераўтворана стары інтэрнат у бібліятэку з больш чым дзесяццю тысячамі кніг.
Аднак канец быў не за гарамі: спачатку Брабантская рэвалюцыя 1789-90 гадоў, затым французскае ўварванне 1793 года. Нарэшце, 1 верасня 1796 года Дырэкторыя адмяніла ўсе рэлігійныя ўстановы. У 1798 годзе бібліятэка была спустошана і ў рэшце рэшт перададзена Гентскому універсітэту. З 1798 года царква абацтва выкарыстоўвалася як музей, але ў 1801 годзе была вернутая ва ўласнасць царквы. У 1810 годзе астатняя частка абацтва перайшла ва ўласнасць горада Гент і была часткова знесена для будаўніцтва ваенных казармаў, якія заставаліся на гэтым месцы да 1948 года.
Прыкладна ў 1950 годзе горад пачаў праграму рэстаўрацыі, якая працягваецца да гэтага часу, якая пачалася з манастыра і Капітула, затым заходняга крыла, уключаючы старую трапезную і кухні. Працы над віннымі скляпамі і гарышчамі былі завершаны ў 1970-х гадах, а ў 1982 годзе былі завершаны работы над садамі абацтва, а ў 1986 годзе - над тэрасай. У 1990-я гады пачалася рэстаўрацыя трапезнага крыла.
У цяперашні час абацтва выкарыстоўваецца як музей і выставачны цэнтр, дзе ў 2000 годзе была праведзена буйная выстава ў рамках Года імператара Карла, а ў кастрычніку 2001 года адбылося 88-е пасяджэнне Еўрапейскага савета.
