Залата, наречена театър поради характерната форма на амфитеатъра, е проектирана през 1637 г.за анатомични класове от архитекта на Болонезе Антонио Паолучи, който каза Леванти, ученик на Карачи. Той е покрит смърч дърво и украсена с две поръчки на статуи, изобразяващи в долната част на дванадесет известни Медичи (Хипократ, Гален, Фабрицио Бартолетти, Джироламо Шадалья, Марчело Мальпиги, Карло Фракассати, Мондино-де-Лиуцци, Бартоломео да Вариньяна, Пиетро Д ' Аргелата, Костанцо Варолио, Джулио Чезаре Аранцио, Гаспар Тальякоцци) и в горната част на двадесет и най-известните анатомистов на Болонската на студиото. Катедра читателя, която се извисява над председателството на демонстранта, заобиколен от две статуи, наречени "голи", разположени в 1734 г. на фигурата на Херакъл Лелли, която служи за показване на човешкото тяло, като отворена книга. Над балдахина седи женска фигура, алегория на анатомията, която получава в знак на почит от крилатия путо не цвете, а бедрена кост. Анатомический зала имам сериозни щети в резултат на бомбардировките, която е на 29 януари 1944 разрушила това крило на сградата и е възстановена в непосредствена послевоенном повторно използване на оригинални дървени скулптури, за щастие, възстановени от руините. Това е един от най-старите запазени анатомични театри.
