Першапачаткова гэтая царква, пабудаваная ў 13 стагоддзі і прысвечаная св. Мікалаю, апекуну маракоў, была драўлянай пабудовай. У канцы XIII ст. было прынята рашэнне пабудаваць мураваны касцёл. Аўдэ Керк спачатку меў форму рымскай зальнай царквы, першай царквы такога роду ў Нідэрландах. У 1306 г. царква была асвечана каталіцкім біскупам Утрэхта Гі ван Авеснесам ван Хенегауэнам, скульптурную магілу якога вы ўсё яшчэ можаце ўбачыць на Купале ва Утрэхце.У 1340 годзе Аўдэ-Керк быў пашыраны да надзвычай значнай для горада структуры, у якой у той час налічвалася тры-чатыры тысячы жыхароў. Як ні дзіўна, вялікія пажары ў Амстэрдаме ў 1421 і 1452 гадах, якія знішчылі тады ў асноўным драўляны горад, не пашкодзілі Аўдэ Керк.У 14-м і 15-м стагоддзях царква была парафіяльнай царквой Амстэрдама, і, паколькі горад хутка рос, Аўдэ Керк некалькі разоў перабудоўваўся і пашыраўся. У 1565 годзе Аўдэ Керк атрымаў званіцу і з таго часу яе архітэктура практычна не змянілася.
