Археологическият музей се намира в необичаен архитектурен контекст, бивш манастир Маджоре Сан Маурицио, основан през 8 век, където историята на древния Милано все още показва следите му. Площ е заета от жилищни сграда на I век от нашата ера, стени и голям римски цирк, прилежащия императорскому двореца на края на III век от нашата ера, от които са запазени значителни останки.
Колекциите са изложени в различни зали в зависимост от културата, към която принадлежат. На приземния етаж, покрай първото жилище (архитектурна украса от милански произход) се намира секция, посветена на Милано Антика. Маршрутът на посещението продължава във вътрешния манастир ("миланското общество чрез епиграфи"), където може да се посети многоъгълната кула (края на III век) със стенописи altomedioevali (XIII век).
В сутерена можете да посетите секцията за изкуство на Гандхар и секцията за живеене в Mediolanum. От вътрешния манастир на музея, по пътеката, която минава през римските стени, ще стигнете до сградата Via Nirone 7, новото разширение на музея. На първия етаж, в близост до конферентната зала, има маршрут, посветен на древната музика (тихи звуци. Снимки и музикални инструменти на Гражданския археологически музей в Милано). На първия етаж са изложени в раздела на ранното средновековие, в съответствие с раздела на етруските, докато на третия етаж е посветена на секцията На гръцки. От малката зала в края на етруската секция можете да разгледате двете римски кули на манастирския комплекс Маджоре. Вътре в многоъгълната кула от стени е изложена скулптура, дарена на община Милано от Миммо Паладино. Египетски, праисторически и Протосторски колекции са изложени в залите на виконтския замък Сфорца.