Заснаванне заалагічнай станцыі датуецца сакавіком 1872 года. Антон Дорн, заснавальнік і першы дырэктар, нарадзіўся ў Штэціне, у Памераніі, цяпер частка Польшчы, у 1840 годзе ў сям'і сярэдняга класа. Дорн вывучаў заалогію і медыцыну ў розных нямецкіх універсітэтах, але без асаблівага энтузіязму. Яго ідэалы змяніліся летам 1862 года, калі ён прыбыў у Ену і сустрэў там Эрнста Гекеля, які пазнаёміў яго з працамі і тэорыямі Чарльза Дарвіна. Дорн стаў гарачым абаронцам тэорыі Дарвіна аб "паходжанні з мадыфікацыяй", тэорыі эвалюцыі шляхам натуральнага адбору. Затым ён вырашыў прысвяціць сваё жыццё збору фактаў і ідэй у падтрымку дарвінізму, і гэта стала адпраўной кропкай прыгоды на ўсё жыццё. Падчас сваёй універсітэцкай кар'еры ён праводзіў даследаванні на беразе мора: у Гельгаландзе, у Гамбургу, у Мілпорце ў Шатландыі і ў Месіне. Тут сфарміраваўся праект пакрыцця зямнога шара сеткай біялагічных даследчых станцый, падобных на вакзалы, дзе навукоўцы маглі б спыняцца, збіраць матэрыял, праводзіць назіранні і эксперыменты, перш чым перайсці да наступнай станцыі.Сутыкнуўшыся са шматлікімі цяжкасцямі, Дорн пачаў фантазіраваць аб магчымасці для марскіх біёлагаў прыбыць у мора і знайсці гатовы працоўны стол з лабараторыяй, паслугамі, хімічнымі рэчывамі, часопісамі і кнігамі і інфармацыяй аб тым, дзе і калі могуць знаходзіцца пэўныя віды. знойдзены разам з карыснай інфармацыяй аб мясцовых умовах мора, марскога дна і ўзбярэжжаў. Дорн, паспрабаваўшы ажыццявіць свой праект у Месіне, вырашыў, што Неапаль будзе ідэальным месцам для яго станцыі. Выбар гэтага горада быў абумоўлены вялікім біялагічным багаццем Міжземнага мора, а таксама магчымасцю развіцця даследчага інстытута вялікага міжнароднага значэння ў самім горадзе з міжнародным пакліканнем і вялікімі памерамі. Пасля наведвання Берлінскага акварыума, які толькі што адкрыўся, ён падумаў, што грамадскі акварыум мог бы зарабіць дастаткова, каб аплаціць пастаяннага лабаранта. Неапаль з яго 500 000 жыхарамі быў адным з найбуйнейшых і прывабных еўрапейскіх гарадоў са значным прытокам турыстаў (30 000 у год), патэнцыйных наведвальнікаў акварыума.Аб'яднаўшы фантазію, сілу волі, дыпламатычнае майстэрства і добрую порцыю ўдачы, дзякуючы сяброўскай падтрымцы навукоўцаў, мастакоў і музыкаў, Антон Дорн пераадолеў сумненні, недасведчанасць і непаразуменне і здолеў пераканаць муніцыпальныя ўлады даць яму бясплатна кавалак зямлі на беразе мора, у прыгожай Villa Comunale, затым Каралеўскі парк. Са свайго боку ён абяцаў пабудаваць Заалягічную станцыю за ўласныя сродкі. Дорн дакладна ведаў, чаго хоча і як, і сам падрыхтаваў планы будаўніцтва. Фундамент быў закладзены ў сакавіку 1872 г. і да верасня 1873 г. будынак быў скончаны. Пасля першага будынка, цяпер цэнтральнага, у 1885-1888 гадах быў прыбудаваны другі будынак, злучаны з першым мостам, а ўнутраны двор і заходняя частка былі пабудаваны ў 1905 годзе. Толькі праз пяцьдзесят гадоў бібліятэка будзе устаўлены паміж першым і другім будынкамі.Грамадскі акварыум, які займае плошчу 527 м2, быў адкрыты 26 студзеня 1874 года і застаецца унікальным па гэты дзень, так як ён вельмі мала змяніўся з моманту свайго стварэння, гэта самы стары акварыум 19-га стагоддзя, які ўсё яшчэ працуе, і адзіны прысвечаны выключна фауне і флоры Міжземнамор'я. Ён быў пабудаваны пад кіраўніцтвам Уільяма Элфарда Лойда, англійскага інжынера, які ўдзельнічаў у праектаванні грамадскіх акварыўмаў у Гамбургу і Лондане.Афіцыйнае адкрыццё заалагічнай станцыі адбылося 14 красавіка 1875 года.Згодна з нядаўнімі даследаваннямі па сацыялогіі арганізацыі, Заалагічная станцыя прадбачыла постіндустрыяльную мадэль планавання навуковых даследаванняў у сярэдзіне індустрыяльнай эры, якая аддавала перавагу тыпова актуальным тэмам, такім як міждысцыплінарнасць, кіраўніцкая здольнасць да самафінансавання (праз акварыум і продаж марскіх жывёл іншым навукова-даследчым інстытутам і г.д.), садзейнічанне супрацоўніцтву і ўзаемадзеянню ўсіх людзей, якія ўдзельнічаюць у даследаваннях (супрацоўнікаў, тэхнікаў, рыбакоў і дворнікаў). У яго лабараторыях актыўна працавалі 19 лаўрэатаў Нобелеўскай прэміі, якія далі значны штуршок развіццю біялагічных навук.
