У рымскія часы востраў Патмос быў месцам выгнання, і вучань Ісуса, Святы Ян ў 95 годзе нашай эры апынуўся на востраве, таму што быў прысуджаны да выгнання на два гады. На самай справе Патмос відавочна згадваецца ў працы як месца, дзе ён меў свае бачання, і напісаў Апакаліпсіс, апошнюю з 27 кніг Новага Запавету. Пячора Святой Ганны, у якой гэта павінна было адбыцца, лічыцца адным з самых важных месцаў у хрысціянстве. І па гэтаму Патмос яго называюць "Ерусалімам Міжземнамор'я". Манастыр быў заснаваны Святым Хрыстом падчас арабскага перыяду, у XI стагоддзі, а затым названы ў гонар святога Яна Багаслова. Патмос быў амаль пустынны, калі гэты адораны і адукаваны манах, Санкт Cristodulo ў 1088 папрасіў і атрымаў у кіраванне ўвесь востраў ад візантыйскага імператара Алексія I Комніна, таму што ён заснаваў манастыр у гонар Святога Яна Багаслова. Сан-Крыстодуль заставаўся ў Патмосе да 1108 года, калі ён быў вымушаны пакінуць яго з-за ўварвання турэцкіх піратаў і памёр у тым жа годзе ў Эвбее. Аднак яго мара працягвала натхняць іншых манахаў, якія працягнулі сваю працу ў наступныя стагоддзі і пашырылі манастыр паміж пятнаццатым і семнаццатым стагоддзямі. Падстава манастыра Святога Яна Багаслова паклала пачатак культурнаму і рэлігійнаму шляху, які прывёў Востраў да таго, каб быць арыенцірам для ўсяго хрысціянства. З гэтага часу пачалося дзіўнае развіццё на востраве Патмос, не толькі з культурнай, але і з эканамічнага пункту гледжання. На працягу стагоддзяў, на працягу амаль тысячагоддзя гісторыі манастыр Сан-Джавані заўсёды заставаўся актыўным і захаваў вельмі каштоўныя фрэскі і старажытныя дакументы. Востраў Патмос быў абвешчаны святым Патрыярхатам, сінадычным актам і законам 1155 / 81 грэцкай дзяржавы. Манастыр разам з горадам хору і пячорай апакаліпсісу былі названыя аб'ектам Сусветнай спадчыны ЮНЕСКА ў 1999 годзе за іх высокую універсальную каштоўнасць. Манастыр, бачны звонку, выглядае як крэпасць сваімі ўражлівымі сценамі вышынёй 15 метраў. На самай справе ён быў пабудаваны на самай высокай вяршыні Патмоса з ідэяй стварэння месца, добра абароненага ад піратаў. Пасля смерці манаха было завершана будаўніцтва магутных знешніх сцен галоўнай царквы (так званага Каталікона) трапезнай і некаторых з дваццаці келляў, якімі сёння размяшчаюць манахі. Унутры манастыра шмат двароў, манастыроў і 10 капліц. У цэнтральным двары з трыма вялікімі аркамі, пабудаванымі ў 1698 годзе, знаходзіцца каталіцкая царква, якая складаецца з галоўнай царквы, капліцы Святога Хрыста і капліцы Багародзіцы. Капліца, прысвечаная Багародзіцы, мае прастакутную планіроўку і змяшчае самыя старыя Фрэскі манастыра, якія адносяцца да канца XI стагоддзя. Унутры Царквы, з грэцкім крыжам і цэнтральным купалам, ёсць іканастас 1820 года і некаторыя Фрэскі 17-га стагоддзя.