Манастыры размешчаны на поўначы Арменіі, у Туманскім раёне. Санаин цяпер знаходзіцца ў межах горада Алавердзі, а Ахпат - на паўночны ўсход ад яго, у аднайменнай вёсцы.
Манастыр Санаин, размешчаны на высокім плато, сярод невысокіх будынкаў, рэзка ўзвышаецца на фоне стромкіх, парослых лесам схілаў хрыбта Базум. Ансамблі дапаўняюцца невялікімі цэрквамі, пабудаванымі побач з імі.
За тры стагоддзі ў кляштарах было пабудавана больш за 20 розных цэркваў і капліц, чатыры прыбудовы, пахавальні, званіцы, будынак Акадэміі, кнігасховішча, трапезныя, галерэі, масты і іншыя манументальныя збудаванні, не кажучы ўжо пра шматлікія жылыя і службовыя памяшканні.
Асноўныя манастырскія будынкі згрупаваныя вакол сваіх галоўных храмаў, утвараючы цэласныя архітэктурныя арганізмы. Яны асіметрычныя адносна сваіх галоўных восяў, што надае ім маляўнічасць.
Кампактнасць і гарманічная збалансаванасць комплексаў дасягаюцца дзякуючы таму, што кожны наступны архітэктар зыходзіў са стану ўжо існуючага ансамбля і ўзгадняў з ім форму і планіроўку сваіх уласных будынкаў.
Ансамблі Санаина і Ахпата вылучаюцца не толькі арыгінальнай архітэктурай рэлігійных і асабліва грамадзянскіх будынкаў. Яны таксама вельмі павучальныя як ўзоры горадабудаўнічага мастацтва, якія сведчаць аб высокім майстэрстве армянскіх архітэктараў. Адзначаныя адзінствам і кампактнасцю сваёй асіметрычнай планіроўкі, яны аказалі велізарны ўплыў на развіццё сярэднявечнай армянскай архітэктуры.
