Музеят е създаден през 30-те години на ХХ век в Епископския дворец, пожелан от Корадо Ричи в началото на ХХ век и създаден благодарение на каноника на катедралата Маурицио Кавалини. Принудена да затвори поради някои повреди, претърпени по време на Втората световна война, тя се отваря отново и отново се затваря на различни етапи до края на века, като се сблъсква с непрекъснати и продължителни структурни намеси. Така музеят е отворен отново през 50-те години на миналия век, затворен е през 80-те години, отворен е отново през 90-те години на миналия век, докато не е взето не толкова тежкото решение музеят да бъде преместен в красивата църква "Сант'Агостино".
Музеят е върнат към живот след проекта за оформление на Guicciardini & Magni Architetti; Изложбата представя творби от катедралата и в малка степен от църквите в епархията, но най-голямото ѝ достойнство е, че освен някои картини, скулптури от дърво и глина, свещени одежди, тя съхранява и единствените оцелели мраморни скулптури от големите паметници от XIV в., издигнати в катедралата.
Под лоджията на презвитериума има няколко колони от 11 век. Покрай стълбището се намира надписът на църквата S. Lorenzo a Montalbano, датиращ от X век. Мраморният фриз с изображения на херувими е дело на Мино да Фиезоле. В единадесет арки с трилистни стъпала и две мраморни колони, вероятно принадлежащи на древен хор на абатството "С. Джусто", са изобразени портрети на абати и ангели с готически и латински надписи от XIV век.
В музея са изложени творби на: Доменико ди Микелино, Росо Фиорентино, Балдасари Франческини, Даниеле Ричарели, Стефано ди Антонио Вани, Антонио дел Полайоло, Джамболоня и др.
