Нацыянальны археалагічны музей Неапаля З'яўляецца адным з найстарэйшых і найбольш важных у свеце дзякуючы багацця і унікальнасці спадчыны і яго ўкладу ў Еўрапейскі культурны ландшафт. Паходжанне і фарміраванне калекцый звязаны з фігурай Карла III бурбона, на троне Неапалітанскага каралеўства з 1734 года, і яго культурнай палітыкай: кароль садзейнічаў даследаванню везувійскіх гарадоў, пахаваных у выніку вывяржэння 79 года н. э. (пачалося ў 1738 годзе ў Геркулануме, у 1748 годзе ў Пампеях) і курыраваў стварэнне ў горадзе Фарнезійскага музея, перадаючы з рэзідэнцый Рыма і Пармы частка багатай калекцыі, успадкаванай ад маці Лізаветы Фарнезе.
Ён абавязаны сыну Фердынанду IV праект ўз'яднання ў бягучым будынку, які ўзнік у канцы 1500 - х гадоў з прызначэннем cavallerizza і з 1616 да 1777 штаб-кватэры універсітэта, два ядра калекцыі Фарнезе і калекцыі экспанатаў Везувій ўжо выстаўлены ў Музеі Эркаланезе ў Каралеўскім палацы Аркад.
З 1777 года будынак быў закрануты доўгім этапам рамонтных работ і праектаў пашырэння, ускладзеных на архітэктараў F.Fuga і P. Schiffarelli. На працягу дзесяцігоддзя французскага панавання (1806-1815) былі зробленыя першыя пастаноўкі, і з вяртаннем Бурбонаў ў Неапаль у 1816 годзе ён атрымаў назву Каралеўскага музея Бурбонаў. Задуманы як універсальны музей, у ім размяшчаліся інстытуты і лабараторыі (Каралеўская бібліятэка, Акадэмія малявання, майстэрня папірусаў...), пазней перакладзеныя ў іншыя месцы ў 1957 годзе.
Калекцыі музея, якія сталі нацыянальнымі ў 1860 годзе, былі абагачаны набыццём экспанатаў з раскопак у месцах кампаніі і Паўднёвай Італіі і прыватных калекцый. Перанос карціннай галерэі ў Каподимонте ў 1957 годзе вызначае фактычную фізіяномію археалагічнага музея. У ім захоўваюцца каштоўныя калекцыі і археалагічныя знаходкі, якія вылучаюцца паміж дагістарычным і познім рымскім стагоддзямі, да якіх дадаюцца шматлікія гістарычныя калекцыі, у тым ліку сем'і Фарнезе, Борджа і калекцыі Старажытнага Егіпта.
