Самым величественным, последним и лучше всего сохранившимся храмом в Пестуме является так называемый Храм Нептуна, хотя он почти наверняка был посвящен, как и базилика, Гере. Этот храм с самого начала был признан самым величественным из всех храмов, и поэтому в XVIII веке предполагалось, что он был посвящен богу-покровителю города, который был Посейдоном, Богом моря. Первоначальное греческое название Пестума было Посейдония, а ранние монеты имеют изображение Посейдона: Пестум-это фактически римское название этого места. Посейдония-это город Посейдона, чей латинский эквивалент-Нептун, и поэтому он был назван храмом Нептуна. Посвящение почти наверняка неверно, поскольку терракотовые обетные статуэтки, найденные в святилище, показывают женские типы, обычно идентифицируемые как Гера. Есть также серебряное блюдо с надписью, гласящей: "я священен Гере: укрепи наши луки".