Хонконгският исторически музей е създаден през юли 1975 г., когато градският музей и Художествената галерия са разделени на хонконгския исторически музей и хонконгския музей на изкуствата. Но някои колекции на музея датират от градския музей и Художествената галерия, основана през 1962 г.под Кметството. През 1983 г. музеят е преместен в временно помещение в парка Коулун. Той е преместен в сегашното си помещение на Chatham Road South, Zim Sha Tsui, през 1998 година. Постоянният дом на Историческия музей в Хонг Конг с обща площ от 17 500 м2 се намира в нова сграда, построена по архитектурната концепция на Г-н е.Вернер Джонсън. Новият музей и съседният музей на науката заедно образуват музеен комплекс с хармоничен външен вид и цветова схема.