המבנה הארכיטקטוני, בסגנון רומנסקי-ביזנטי, עשוי כולו מלבנים חשופות, מתוארך למחצית הראשונה של המאה ה-11, וניצב במקום של בזיליקה נוצרית מוקדמת קודמת. החלק הפנימי מחולק לשלוש ספינות על ידי שתי שורות של עמודים ופילסטרים מתחלפים.באפסיס המרכזי הגדול נמצא ה-Pala d'Oro, עבודת צורפות יקרת ערך, המורכבת משישה לוחות בנייר כסף מובלט ומסותת, הטובלים באמבט זהב, עם תמונות קודש שונות; נבנה בתקופות שונות, בחלקו במחצית השנייה של המאה ה-13 ובחלקו במחצית הראשונה של המאה ה-14, אולי במקורו הייתה לו צורה של 'חזית', והוצב על המזבח הראשי של הקתדרלה.המסורת המקומית, שעם זאת אינה מאושרת בתיעוד ההיסטורי, תצביע על החפץ על מתנת קתרינה קורנר, שהציעה המלכה לכנסייה כאות תודה על ההצלה שהתקבלה מכמה דייגים מקאורל, שהיו צריכים. הציל אותה מספינה טרופה מול החוף, במהלך סערה, בשנת 1489, בדיוק כשסיים את מסעו חזרה לוונציה מקפריסין, לאחר התפטרותו.ככל הנראה, הפרשה בוודאי מיוצגת באגן האפסיס עצמו, בפרסקו שכיום כמעט ולא נותר ממנו זכר, אם להוציא שבר שעדיין קריא למדי, המראה את דמותו של האריה של סן מרקו.
