تم تصميم قبر سانت كلير وأراد خارج بورتا أوربيكا ، في كنيسة سان جورجيو ، حيث دفن فرانسيس مؤقتا بالفعل وحيث دفن القديس في 12 أغسطس 1253. كانت كنيسة سان جورجيو خارج بوابة المدينة المتجانسة, أقل قليلا من الطريق, مغادرة المدينة, ترأس "مقابل Ispellum"; ذهب طريق آخر إلى سان روفينو, والثالث, على طول الجدار الروماني, ينحدر نحو بورتا مويانو. لذلك كان يسمى المكان "Tribium S. Georgii". بين الطريق والكنيسة وقفت ، منذ وقت ليس ببعيد ، مستشفى ملحقة بالكنيسة ؛ كل شيء يعتمد على فصل الكاتدرائية.
بينما بالنسبة لضريح الكنيسة ، الذي سيتم تشييده تكريما للقديس فرانسيس ، تم تحديد المكان بعد عامين فقط من وفاته ، من أجل تكريس المكان للقديس كلير ، وجهنا على الفور نحو الجزء المقابل من المدينة ، بجوار كنيسة القديس جورج (مارينو بيغاروني ، كنيسة سانت كلير في أسيزي ، ص 13). بعد ثلاث سنوات من وفاة وسنة واحدة بعد تقديس سانت كلير بدأت في عام 1257 بناء كنيسة سانت كلير حول كنيسة القديس جورج القديمة ، والتي حتى عام 1230 حافظت على رفات القديس فرنسيس. تم نقل بقايا القديس بالفعل في عام 1260 ، في حين تم التكريس الرسمي في عام 1265 ، بحضور كليمنت الرابع. تم تنفيذ أعمال البناء من قبل المهندس المعماري فيليبو دا كامبيلو. تم بناء القبو الذي يضم الآن قبر القديس فقط في عام 1850.