تم بناء الكنيسة من قبل كاثوليكوس كوميتاس فوق الضريح الأصلي الذي بناه كاثوليكوس ساهاك الكبير في عام 395 بعد الميلاد والذي احتوى على بقايا القديس الشهيد هريبسيم-لمن كرست الكنيسة له. تم الانتهاء من الهيكل في عام 618 م. تشتهر بهندستها المعمارية الأرمنية الجميلة في الفترة الكلاسيكية ، والتي أثرت على العديد من الكنائس الأرمنية الأخرى منذ ذلك الحين. هذه الكنيسة جنبا إلى جنب مع المواقع القريبة الأخرى هي أحد مواقع التراث العالمي لليونسكو ، وتقع مدينة إشميادزين الحالية ، أرمينيا في مقاطعة أرمافير.
تقع الكنيسة على بقايا هيكل وثني وأيضا الموقع الذي استشهد فيه القديس المذكور أعلاه خلال فترة تحول أرمينيا إلى المسيحية في عام 301 بعد الميلاد. كتب المؤرخ الأرمني في القرن الخامس أغاثانجيلوس أن هريبسيم الشاب والجميل-الذي كان في ذلك الوقت راهبة مسيحية في روما ، كان من المقرر أن يتزوج بالقوة من الإمبراطور الروماني دقلديانوس. من بين الراهبات الأخريات هربن من الإمبراطور الطاغية وغادرن إلى أرمينيا. تلقى الملك الأرمني الوثني تردات رسالة من دقلديانوس وصف فيها جمالها. اكتشف تردات مكان اختباء الراهبات ، ووقع في حب هريبسيم later ولاحقا جايان.. بعد رفضها لتقدمه ، تعرضت هريبسيم للتعذيب والاستشهاد في موقع هذه الكنيسة ، بينما تعرضت غايان للتعذيب والاستشهاد في مكان منفصل حيث تم بناء الكنيسة باسمها لاحقا. استشهدت راهبة ثالثة لم تذكر اسمها في موقع شغاكات. خلال الوقت الذي كان فيه هريبسيم-يتعرض للتعذيب ، أخبرها جايان-أن "تبتهج جيدا ، وتقف بحزم" في إيمانها. كان من المقرر أن يتحول الملك تردات لاحقا إلى المسيحية وجعلها الديانة الرسمية للمملكة.
في أوائل القرن 4 ، رأى القديس غريغوريوس المنور رؤية نزل فيها المسيح من السماء ، وضرب الأرض بمطرقة ذهبية لتسوية ذلك. في مكانها رأى الموقع الذي استشهد فيه هريبسيم ، مع قاعدة حمراء ترمز إلى الدم تحت " أعمدة السحب ، تيجان النار ، وعلى رأسها صليب من الضوء."في الرؤية ، يطلب منه المسيح إقامة نصب تذكاري لهريبسمي في المكان المحدد. تم تعيين القديس غريغوريوس لوضع الأسس في المكان الذي استشهد فيه هريبسيم.
