พิพิธภัณฑสถานแห่งชาติซานโฮเซเป็นหนึ่งในพิพิธภัณฑ์ที่สำคัญและมีชื่อเสียงที่สุดในคอสตาริกา พิพิธภัณฑ์ ตั้งอยู่ในอาคารเก่าแก่ที่เดิมเคยเป็นกองบัญชาการทหาร พิพิธภัณฑ์แห่งนี้อุทิศให้กับประวัติศาสตร์และวัฒนธรรมของคอสตาริกาตั้งแต่ยุคก่อนประวัติศาสตร์จนถึงปัจจุบันพิพิธภัณฑสถานแห่งชาติก่อตั้งขึ้นในปี พ.ศ. 2430 โดยประธานาธิบดีของคอสตาริกา ราฟาเอล อิเกลเซียส และเริ่มแรกตั้งอยู่ในอาคารถัดจากวิหารซานโฮเซ ในปี 1950 พิพิธภัณฑ์ได้ย้ายไปยังตำแหน่งปัจจุบัน ซึ่งเป็นอาคารเก่าแก่ของกองบัญชาการกองทัพเก่า อาคารนี้สร้างขึ้นในศตวรรษที่ 19 และมีสไตล์นีโอคลาสสิกพร้อมลานตรงกลางและบันไดขนาดใหญ่คอลเล็กชันของพิพิธภัณฑสถานแห่งชาติประกอบด้วยวัตถุต่างๆ มากมาย รวมถึงเซรามิก รูปปั้น เหรียญ อาวุธ เสื้อผ้า และสิ่งของอื่นๆ ที่แสดงถึงประวัติศาสตร์และวัฒนธรรมของคอสตาริกา นอกจากนี้ พิพิธภัณฑ์ยังเป็นที่เก็บคอลเล็กชันศิลปะยุคก่อนโคลัมบัสที่สำคัญ ได้แก่ วัตถุเซรามิกและทองคำหนึ่งในสิ่งจัดแสดงที่โดดเด่นที่สุดของพิพิธภัณฑสถานแห่งชาติ ได้แก่ นิทรรศการที่อุทิศให้กับหินทรงกลม ชุดหินทรงกลมขนาดใหญ่ที่พบในส่วนต่างๆ ของประเทศ ทรงกลมเหล่านี้มีอายุย้อนไปถึงยุคก่อนโคลัมบัส ถูกตัดและทำงานด้วยความแม่นยำสูง นักวิชาการจึงตีความไปต่างๆ นานาเกร็ดเล็กเกร็ดน้อยที่น่าสนใจเกี่ยวกับสิ่งที่เรียกว่า "ห้องทอง" ของพิพิธภัณฑ์ ซึ่งเป็นห้องที่บรรจุวัตถุทองคำยุคก่อนโคลัมบัสจำนวนมาก ห้องนี้ตกเป็นเป้าของการโจรกรรมในปี 1954 เมื่อหัวขโมยสามารถเข้ามาขโมยงานศิลปะหลายชิ้นได้ รัฐบาลคอสตาริกาเริ่มปฏิบัติการค้นหาครั้งใหญ่ และไม่นานนักหัวขโมยก็ถูกจับได้และวัตถุศิลปะก็ได้รับการกู้คืนมาพิพิธภัณฑ์แห่งชาติซานโฮเซยังคงเป็นหนึ่งในพิพิธภัณฑ์ที่สำคัญที่สุดในคอสตาริกา และดึงดูดผู้เข้าชมจำนวนมากในแต่ละปี พิพิธภัณฑ์เปิดให้บุคคลทั่วไปเข้าชมตั้งแต่วันอังคารถึงวันอาทิตย์ และให้บริการนำเที่ยว กิจกรรม และนิทรรศการชั่วคราว
