Villa dei Misteri อันยิ่งใหญ่อาจเป็นอาคารที่มีชื่อเสียงที่สุดในบรรดาการขุดค้นทั้งหมด ประกอบด้วยห้องพักประมาณหกสิบห้อง และเป็นซากปรักหักพังของที่อยู่อาศัยของชาวโรมันชานเมือง ซึ่งอยู่ห่างจากเมืองปอมเปอีไปทางตะวันตกเฉียงเหนือประมาณ 800 เมตร ชื่อนี้มาจากภาพเฟรสโกที่พบในห้องๆ หนึ่งของบ้าน ซึ่งตามความเห็นของนักวิชาการส่วนใหญ่ แสดงถึงการเริ่มต้นของเจ้าสาวไปสู่ความสุขของไดโอนีเซียนบางส่วนถูกค้นพบในปี 1909-1910 คอมเพล็กซ์เป็นตัวอย่างที่น่าชื่นชมของส่วนผสมของวิลล่า d'otium และวิลล่าชนบท ซึ่งบางทีอาจเป็นของตระกูล Istacidii ซึ่งเป็นหนึ่งในกลุ่มที่สำคัญที่สุดในปอมเปอีในยุคออกัสตัส จากการศึกษาล่าสุดพบว่ารูปแบบสถาปัตยกรรมย้อนหลังไปถึงศตวรรษที่ 1 ก่อนคริสต์ศักราช ค. มีการแปรสภาพต่อเนื่องกันจนถึงเวลาปะทุ (ค.ศ. 79).รูปแบบปัจจุบันของวิลล่าเกิดจากการแทรกแซงที่เกิดขึ้นหลังจากแผ่นดินไหวในปี ค.ศ. 62 เมื่อการแปลงอาคารจากวิลล่าที่อยู่อาศัยเป็นศูนย์เกษตรกรรมและการผลิตเริ่มขึ้น ในช่วงเวลาของการปะทุในปี ค.ศ. 79 งานกำลังดำเนินการเพื่อปรับโครงสร้างโดยเจ้าของคนสุดท้ายย่านที่อยู่อาศัยอันหรูหราตั้งอยู่ทางฝั่งตะวันตกและมองเห็นทะเลได้ โดยตั้งอยู่บนแกนมุมมองที่ชี้นำซึ่งประกอบด้วยลำดับของห้องโถงใหญ่ โต๊ะ และห้องนั่งเล่นปิดท้ายด้วย exedra ครึ่งวงกลมแบบพาโนรามาจากห้องนั่งเล่นที่มี exedra ทางเดินด้านข้างจะนำไปสู่ Sala dei Misteri ชื่อของวิลล่ามาจากจิตรกรรมฝาผนังที่ประดับด้วยไตรคลีเนียมหลังนี้Sala dei Misteri ได้รับการสวมมงกุฎด้วยภาพวงจรพิเศษที่นักวิชาการถกเถียงกันอย่างกว้างขวาง ซึ่งตรงบริเวณกลางห้อง เหนือแท่นที่ประดับด้วยหินอ่อนเทียมซึ่งทำหน้าที่เป็นแท่น ฉากนี้ถูกครอบงำโดยคู่รักศักดิ์สิทธิ์ที่วางอยู่ตรงกลางของกำแพงด้านหลัง ซึ่ง Dionysus และ Aphrodite (หรือ Ariadne) ระบุตัวตนจุดไคลแม็กซ์ของความตึงเครียดในการเล่าเรื่องมาถึงฉากพิธีกรรมที่ผู้หญิงคุกเข่าเปิดโปงลึงค์ ขณะที่ตัวละครมีปีกตั้งใจทำพิธีกรรมเฆี่ยนตี
