1943年に設立され、1982年に現在のラモン・イ・カハル通りに開館するまで、さまざまな場所にありました。この博物館は、数年前に発掘されたローマ時代後期のネクロポリスの上に位置しています。 ネクロポリスは、この博物館の特徴を最もよく表している建造物ですが、それに加えて、スペインで最も優れた葬儀碑文のコレクションも特筆に値します。また、ローマ時代の採掘場では、当時の製品、道具、器具の様々な種類が展示されています。また、陶器は主に食器で、紀元前2世紀からこの港で行われていた激しい商業活動の証となるものです。 ローマ時代の彫刻にも良い例があり、中でも王冠をかぶった子供の肖像画は、おそらく皇室の高い威厳を表していると思われ、その見事な出来栄えに目を見張ります。2階の常設展示は、ローマ時代の住居や商業に関する展示で締めくくられています。 1967年に発見、発掘された。この発見がもたらした興味から、カルタヘナ市議会は、この遺跡の周辺に博物館の新しい本部を建設することを検討しました。このプロジェクトは、当時の博物館長であった建築家ペドロ・アントニオ・サン・マルティンが担当し、ネクロポリスを囲む2つのフロアを現在と同じように設計しています。
このネクロポリスで最も目を引くのは、この時代にはほとんど例がないことに加え、紀元4世紀後半から5世紀前半の、キリスト教の伝来と同時期の、埋葬の類型的な多様性である。個々の墓のほかに、長方形や半円形の古墳があり、2つのパンテオンが存在する。