この博物館は、1929年から1931年にかけて湖水で回収されたカリギュラ皇帝（紀元37～41年）の巨大な船2隻を収容するために、1933年から1939年にかけて建設された。そのため、イタリアで最初の博物館として、71.30×20mと73×24mの2つの船体を展示することになったが、残念ながら1944年の火災で焼失してしまった。1953年に再開され、1962年に再び閉鎖され、1988年にようやく再オープンした。
新しいレイアウトでは、左翼が船専用となっており、青銅瓦による屋根の復元、2つの錨、船首車輪の内張り、オリジナルまたは復元された船内設備（ノリア、ピストンポンプ、ブロック、ボールベアリング上のプラットフォーム）など、いくつかの資料を展示しています。また、1/5スケールの模型2隻と、1番船の船尾の柱を原寸大で復元し、その上にフェリン原器が入った箱のブロンズ製レプリカを配置しています。
ヴェレトリ（サン・クレメンテ）、カンポヴェルデ（ラティーナ）、ジェンツァーノ（パンタナッチの杖）、ネミのディアナの聖域などの奉納品や、ルスポリコレクションの資料が展示されています。この棟の内部には、アリッチャからディアナの聖域へと続くローマ時代の敷石「クリヴス・ヴィルビイ」の一部も展示されています。
