该博物馆建于1933年至1939年间，用于存放1929年至1931年间在湖水中发现的属于卡里古拉皇帝（公元37-41年）的两艘巨大的船只。因此，它是意大利第一个为其内容物建造的博物馆，两个分别为71.30×20米和73×24米的船体，不幸在1944年的一场火灾中被毁。该博物馆于1953年重新开放，1962年再次关闭，最后于1988年重新开放。
在新的布局中，左翼专门用于展示船舶，其中一些材料被展出，如用青铜瓦片重建的屋顶、两个锚、船头轮的内衬、一些原始或重建的船上设备（一个诺利亚、一个活塞泵、一个木块、一个滚珠轴承平台）。此外，还展出了两艘1:5比例的船舶模型，以及第一艘船的船尾柱状物的全尺寸重建，上面放置了带有铁质原件的铜质盒子。
另一方面，右翼致力于介绍共和国和帝国时代阿尔巴尼亚领土上的人口情况，特别关注礼拜场所；来自Velletri（S. Clemente）、Campoverde（Latina）、Genzano（Pantanacci的柄）和Nemi的Diana圣地的祭祀材料，以及Ruspoli收藏的材料都在这里展出。在这个侧翼内，还可以欣赏到罗马人铺路石的一部分，即从阿里西亚通往戴安娜圣地的clivus Virbii。
