Прызнаная аб'ектам Сусветнай спадчыны ЮНЕСКА, базіліка Святога Францыска была пабудавана пад кіраўніцтвам брата Эліяса, Генеральнага вікарыя і архітэктара ордэна, пачынаючы з 1228 года, усяго праз два гады пасля смерці святога, як месца, прызначанае для пахавання яго парэшткаў. Папа Рыгор IX заклаў першы камень 17 ліпеня 1228 года, на наступны дзень пасля кананізацыі святога Францыска, на месцы, якое раней выкарыстоўвалася для пакаранняў смерцю і пахаванняў злачынцаў. Паводле падання, сам Францішак на смяротным ложы паказаў гэтае месца сваім спадарожнікам як месца для свайго пахавання. Пастава Знешні выгляд базілікі мае відавочныя дасылкі да французскай готыкі ў парылым фасадзе і двухдольных дзвярным праёме, асветленым гарызантальнымі кранштэйнамі і ружовым акном з тыпова умбрийским знешнім выглядам, а таксама з цяжкай, шырокай званіцай. Усе паверхні выкладзеныя каменем з гары Субазио, які днём мае ружовы колер і ззяе белым у святле месяца. Ніжняя царква Наведвальнікі ўваходзяць у ніжнюю базіліку збоку, праз двайны дзвярны праём 13 стагоддзя, увянчаны проці-ром эпохі Адраджэння. Інтэр'ер мае адзін Нава, падзелены на пяць адсекаў нізкімі аркадамі, з бакавымі капліцамі канца 13 стагоддзя. У першым адсеку, ля ўваходу, выстаўлены дзве вялікія гатычныя грабніцы 14 стагоддзя, а паміж імі-кафедра з падставай 13 стагоддзя, з заднімі прыбудовамі і пераробкамі. Насупраць уваходу знаходзіцца Капліца Святой Кацярыны, або распяцця, упрыгожаная цыклам фрэсак балонца Андрэа Барталі (1368) і асветленая шматстворкавымі вокнамі 14 стагоддзя. Шматколернае драўлянае распяцце на алтары датуецца канцом пятнаццатага стагоддзя. На сценах нефа захаваліся рэшткі фрэсак са сцэнамі запалу Хрыстовых (справа) і гісторыямі з жыцця Святога Францыска (злева), напісаных так званым майстрам Святога Францыска (каля 1253 года). Бліжэй да канца левай сцяны, у нішы над гатычным узвышэннем, знаходзіцца фрэска Пуччо Капанен" Каранацыя Панны Марыі " (14 ст.). У сярэдзіне нефа лесвіца вядзе ўніз у склеп; за алтаром знаходзіцца урна з парэшткамі Святога, абароненая жалезнай кратамі. Вяртаючыся да царквы, Капліца Магдаліны захоўвае каштоўныя Фрэскі (прыкладна 1314 года), якія паказваюць гісторыі Марыі Магдаліны і святых, якія прыпісваюцца школе Джотто, і, магчыма, якія ўключаюць некаторыя карціны, напісаныя рукой майстра. У першай капліцы злева прадстаўлены эпізоды з жыцця святога Марціна, напісаныя Сімонай Марціні (1312-1320). У склепным пераходзе, над гатычным алтаром, знаходзяцца іншыя фрэскі, якія прыпісваюцца памочнікам Джотто, у тым ліку маэстра дэла Веле (майстру асізскіх склепов). Сцены і бочкападобны звод правага трансепта захавалі Фрэскі школы Джотто і Мадону на троне з анёламі і Святым Францыскам, цудоўную кампазіцыю Чимабуэ, якая была часткова паменшаная. На суседняй сцяне ў канцы знаходзяцца пяць фігур святых, якія прыпісваюцца Сімоне Марціні. Капліца Святога Мікалая таксама ўпрыгожана фрэскамі школы Джотто (1300-1310), магчыма, выкананымі пры садзейнічанні самога майстра і прадстаўляюць гісторыі гэтага святога. У нішы над алтаром знаходзіцца гатычная грабніца Джавані Гаэтана Орсини працы невядомага умбрийского майстра. На сценах і на зборы левага трансепта наведвальнікі могуць палюбавацца цыклам запалу Хрыстовых і Мадоннай са святымі працы П'етра Ларэнцэці і яго майстэрні (1315-20), а таксама іншымі карцінамі. Верхняя царква Калі ўрачыстая і цёмная ніжняя базіліка запрашае да пакаяння і цішыні, то верхняя царква ўзнімаецца ў неба, паветраная і светлая. Выкананы ў гатычным стылі з французскім уплывам, Нава мае чатыры пралёты, папярочныя скляпенні, шматкутны трансепт і апсіду. Трансепт цудоўна упрыгожаны фрэскамі Чимабуэ са знакамітым распяццем, сцэнамі апакаліпсісу і гісторыямі аб Святым Пятры. Цыкл, пачаты ў 1277 годзе, быў пашкоджаны зменамі, у якіх белы колер набыў цёмны адценне, надаючы некаторым малюнках выгляд фатаграфічных негатываў. Чимабуэ і яго памочнікі таксама намалявалі чатырох евангелістаў на столі над гатычным галоўным алтаром і фрэскі з гісторыямі пра Марыю на сценах. У верхняй частцы нефа знаходзіцца цыкл фрэсак з сюжэтамі з новага і Старога Запавету, якія, як лічыцца, часткова належаць мастакам Рымскай школы, а часткова паслядоўнікам Чимабуэ. Прастору апавядальных сцэн перамяжоўваецца вокнамі, упрыгожанымі сярэднявечнымі вітражамі, якія, нягледзячы на рэканструкцыю, складаюць адзін з самых поўных падобных камплектаў у Італіі. Ніжняя частка сцен нефа ўпрыгожана знакамітым цыклам фрэсак, распрацаваным Джотто, які кіраваў яго завяршэннем іншымі рукамі. Цыкл змяшчае сцэны з жыцця святога Францыска, ад яго юнацтва да смерці і да прыпісваюцца яму пасмяротных цудаў, апраўленыя размаляванай архітэктурай з выявай калон і кранштэйнаў.