Pravo rano franjevačko središte, Porciuncola, postalo je jedno od najvažnijih mjesta hodočašća, toliko da je papa pobožni Ninsus na kraju katedrale u Trentonu odlučio sagraditi ovu veliku baziliku s ciljem davanja novog života redu Male braće i dostojan doček mnogim vjernicima koji su već posjetili Porciuncolu. Crkva ima tri lađe, s ne izbočenim transeptom, križnim kupolastim tlocrtom i polukružnom apsidom koju je projektirao Galeazzo Alessi; dovršen je 1679 .godine izgradnjom zvonika s desne strane, koji je trebao odgovarati zvoniku s lijeve strane, koji završava neposredno iznad krov crkve. Potresi 1832. doveli su do urušavanja središnje lađe do poprečnog svoda, dijelova bočne i gornje fasade, dok su kupola i apsida zadržani. Kapela Porciuncola, izgleda kao mala crkva smještena neposredno ispod kupole. Početkom 13.stoljeća crkva je napuštena među hrastovima koji su pripadali benediktinskim redovnicima Subasio. Oko 1205.godine Franjo je tamo osnovao svoj dom, obnovio crkvu i osnovao franjevački red. Prve redovničke kolibe, izrađene od gline i trske, izgrađene su oko Porciunkole. Bilo je to mjesto gdje je sveti Franjo najčešće živio, gdje je Svetoj Klari dao vjerski ogrtač (1212.) i gdje je održao Kaptol Matsa (1221.) u kojem je sudjelovalo više od 5000 redovnika. Tradicija kaže da je ovdje sveti Franjo primio potpunu oprost od Djevice Marije. Porciunkola je vrlo jednostavna pravokutna konstrukcija izrađena od polikromnog kamena iz Subazija. Gornji dio pročelja prekriven je freskom ("oprost Assisija") Friedricha Overbecka iz Lubecka (1829.). S desne strane nalaze se ostaci dviju freski iz petnaestog stoljeća s utjecajem Siene: Madona i dijete između svetog Franje i Svetog Bernardina. Sa stražnje strane nalazi se freska Perugino "Kalvarija" (čiji je gornji dio izgubljen). Unutrašnjost (čekići na vratima datiraju iz petnaestog stoljeća) ima poprečni rebrasti svod, blago pocrnjeli dimom svjetiljki; na oltaru je Navještenje i priče o oprostu, velika ploča Hilario da Viterbo (1393.), koji je također napravio fresku na zidu. kripta s evanđelistima; na lijevom zidu je freska imaga Pietatisa.