Першым умацаваннем на гэтым месцы была вежа з чатырохкутнай падставай, пабудаваная паміж 1583 і 1585 гадамі фларэнтыйскім архітэктарам Каміла Камілані па загадзе Маркантоніа II калоны малодшага, віцэ-караля Сіцыліі, у рамках плана абароны сіцылійскага ўзбярэжжа. Будаўніцтва цяперашняга форта было пачата ў 1615 годзе Эрнанда Пеціньё, камандуючым каралеўскай кавалерыяй Сіцыліі і ваенным губернатарам Сіракузах. Старая вежа была ўключана ў склад новага форта. Будаўніцтва было перапынена да 1636 года, калі працы аднавіліся пад кіраўніцтвам Серпионе Коттоне, маркіза д'альтамура. Форт быў дабудаваны і адкрыты ў 1640 годзе і ўяўляе сабой рэдкі прыклад крэпасці ў стылі барока, некалькі з якіх паўсталі на Сіцыліі ў 17 стагоддзі. Форт Сант-Анджэла ніколі не падвяргаўся нападу і быў дэмілітарызаваны ў 19 стагоддзі, калі з 1849 па 1856 год ён выкарыстоўваўся ў якасці месца размяшчэння ўрадавага тэлеграфа. У пачатку 1900-х гадоў у Фортэ быў размешчаны гарнізон Ваенна-паветраных сіл, і форт стаў маяком. Раніцай 10 ліпеня 1943 года, у так званы Дзень " Д " англа-амерыканскай высадкі на Сіцыліі, форт Сант-Анджэла быў абстраляны амерыканскім лёгкім крэйсерам USS Brooklyn і эсмінцам USS Buck. Гэта нанесла вялікі ўрон, які пазней быў ліквідаваны. У 1965 годзе эксплуатацыя маяка была адменена, і форт быў закінуты.