Petra osnovao je krajem 7.stoljeća Amandus, misionar kojeg su franački kraljevi poslali na obraćenje poganskih stanovnika regije, koji je na tom području osnovao dva samostana: Sv. Normani su Opatiju pretresli i opljačkali tijekom zime 879-80., a ostala je relativno siromašna sve do 10. stoljeća, kada su je donacije posjeda i relikvija grofa Arnulfa Earlsa znatno obogatile, kao i daljnje donacije arnulfovog rođaka, engleskog kralja Edgara. Do druge polovice stoljeća bila je najbogatija Opatija u Flandriji, a ugled opatijske škole proširio se daleko izvan gradskih granica. 984. Herbert iz Aurillaca, ravnatelj katedralne škole u Reimsu (kasnije papa Silvester Sosin), pitao se mogu li učenici iz Reimsa biti primljeni u Sveti Petar, a njegova slava kao središta slobodnih umjetnosti nastavila se i u 11.stoljeću. Sveti Petar, zahvaljujući svom posjedu velikih zemljišnih parcela, također je igrao pionirsku ulogu u poljoprivredi u 12.i 13. stoljeću, pretvarajući šume, močvare i močvare u poljoprivredno zemljište. U 15.stoljeću opsežni program gradnje stvorio je Opatijsku knjižnicu i skriptorij, proširio trpezariju, a Opatijska crkva i druge zgrade znatno su ukrašene. Prvo propadanje Svetog Petra započelo je nakon pobune u Gentu 1539.godine, a do 1560-ih Nizozemska je pala u vjersku krizu koja je dovela do napada ikonoklasta 1566. godine, što je rezultiralo uništenjem opatijske crkve, pljačkom Knjižnice i teško oštećenim drugim zgradama. Ambulanta je korištena kao privremeni stan za redovnike, a trpezarija je korištena kao mjesto bogoslužja. Međutim, otpor se nastavio i 1578. opat i redovnici bili su prisiljeni pobjeći u Douai. Zgrade Opatije prodane su na javnoj dražbi i djelomično srušene, a materijali su korišteni za izgradnju gradskih zidina. Opatija se napokon vratila u ruke crkve 1584.godine, a na kraju je obnovljena novom crkvom Opatije sagrađenom 1629. godine u baroknom stilu, kao i nekoliko drugih novih građevina i obnova. U 18.stoljeću Opatija je ponovno procvjetala, jer su izgrađene nove zgrade, a stare proširene, uključujući pretvaranje stare spavaonice u knjižnicu s više od deset tisuća knjiga. Međutim, kraj je bio odmah iza ugla: prvo Brabantska revolucija 1789-90, zatim Francuska invazija 1793. Napokon, imenik je ukinuo sve vjerske institucije 1.Rujna 1796. 1798. knjižnica je ispražnjena i na kraju predana Sveučilištu u Gentu. Od 1798. godine crkva Opatije korištena je kao muzej, ali je vraćena u vlasništvo Crkve 1801. 1810.ostatak Opatije prešao je u vlasništvo grada Genta i djelomično je srušen za izgradnju vojne vojarne koja je na tom mjestu ostala do 1948. Oko 1950.godine grad je započeo program obnove koji se nastavlja i danas, koji je započeo samostanom i Kaptolom, zatim zapadnim krilom, uključujući staru trpezariju i kuhinje. Radovi na vinskim podrumima i tavanima završeni su 1970-ih, a radovi na vrtovima Opatije dovršeni su 1982., a terasa 1986. 1990-ih započela je obnova trpezarijskog krila. Opatija se trenutno koristi kao muzej i izložbeni centar, gdje je 2000.godine održana velika izložba u sklopu godine cara Karla, a u listopadu 2001. održan je 88. sastanak Europskog vijeća.