Basilikaens struktur, som vi kan beundre i dag, afspejler den grundlæggende arkitektur, der designede Giulio Romanos geni, og som repræsenterer kompendiet af de fremtrædende øjeblikke i historien og de politiske civilisationer. Mellem 1540 og 1545 genopbyggede han uden at nedbryde de gamle romanske og gotiske strukturer ved at vedtage originale løsninger for at samle forskellige arkitektoniske stilarter og skabe et raffineret og homogent interiør. Romansk er faktisk de ambulante og de murede søjler, men stadig synlige, i præsteriet, mens gotisk er tiburium og hvælvingerne. Antonio Begarelli, en kunstner fra Modena, som Vasari kalder "Michelangelo of terracotta", lavet i 1542 og 1559, 32 statuer af helgener, der leverer Navene og pryder indgangene til sidekapellerne. Den vidunderlige sakristi er indrettet med udskårne skabe, udført mellem 1561 og 1563, af Giovanni Maria Piantavigna. I rummet mellem transeptet og sakristiet er der graven til Matilde Di Canossa, en alabast sarkofag understøttet af fire røde marmorløver. Matildas lig har ikke været i hendes grav siden 1633, da det blev overført til Peterskirken i Rom. Inde i basilikaen er der også Oratoriet for Santa Maria dateret mellem slutningen af secolo det menes, at Grevinde Matilda oprindeligt blev begravet her, i en urne begravet foran alteret, i korrespondance med den store mosaik med de fire kardinal dyder. Turister kan under deres besøg beundre skønheden i de tre klostre, den sekulære, San Simeone og San Benedetto: Det verdslige kloster, hvoraf du kan se mindst tre konstitutive faser (en fase før det tredje århundrede, en fra 1475 og en fra 1674) var beregnet til at byde pilgrimme og de fattige velkommen i stueetagen (øst-og sydsiden), mens den øverste etage var dedikeret til specielle gæster. Fra chiostro dei Secolari, der krydser den spektakulære Barberini-trappe, kommer du ind i Polironiano Civic Museum. Fortsætter på bagsiden af basilikaen, der er klosteret St. Simeon, hvis øverste etage engang var besat af den gamle sygeafdeling mod øst, biblioteket og abbedens bolig mod syd, munkenes sovesale mod vest og Nord. I stueetagen var der i stedet cellerne til de forbipasserende munke, kælderen, skrædderbutikken og skomageriet. Klosteret, i sengotisk stil, antog sit nuværende udseende mellem 1458 og 1480. Også til denne periode kan dateres freskerne i Lunettes med historierne om St. Simeon, lavet af kunstnere måske af den flamske skole. Fra dette pragtfulde kloster kan du direkte få adgang til kapitelrummet, et af de ældste og vigtigste steder i klosteret som det styrende centrum for cenobio; indeni kan du beundre resterne af Grave af abbeder fra '500. Forlader hallen kan du beundre den største kloster, dedikeret til St. Benedict. Ombygget omkring 1450 som en del af den arkitektoniske renovering af Polirone støttet af rosende Guido Gonsaga, blev den ændret på den sydlige side efter renoveringen af klosterkirken udført af Giulio Romano.