Die Kirche und das angrenzende Kloster werden seit 1016 erwähnt, als die Kapelle, die hier stand, vom Benediktinermönch Bono umgebaut und dem Erzengel Michael geweiht wurde. Der Komplex ging zwischen 1105 und 1111 an die Kamaldulensermönche über und blieb dort bis 1782, dem Jahr der Aufhebung, woraufhin die Kirche in ein Priorat umgewandelt wurde. Das heutige Gebäude ist das Ergebnis einer langen Reihe von Umbauten, die im 13. Jahrhundert begannen und mit der Umgestaltung des mittelalterlichen Glockenturms im Jahr 1676, der spätbarocken Renovierung in der Mitte des 18. Jahrhunderts und dem Wiederaufbau nach dem Erdbeben von 1846 bis hin zum Wiederaufbau nach dem Krieg im Jahr 1963 fortgesetzt wurden. Die Fassade mit ihrer Marmorverkleidung stammt aus dem 14. Jahrhundert und zeichnet sich durch drei Portale im unteren Teil aus: das mittlere wird von einer gotischen Ädikula überragt, die die Madonna mit Kind, Engeln und dem Abtopfer von Lupo di Francesco umrahmt (Originale im Museo di S. Matteo), und einen oberen Teil mit drei Reihen kleiner Loggien. Die Inschriften im unteren Teil der Fassade verweisen auf eine Wahl des Rektors der Universität zu Beginn des 17. Jahrhunderts. Die drei Innenschiffe werden von Säulen mit romanischen Kapitellen getragen, während der Hochaltar über der Krypta aus dem 11. und 12. Jahrhundert errichtet wurde. Ein Kruzifix aus dem 14. Jahrhundert, das Nino Pisano zugeschrieben wird, ist hier zu sehen; ansonsten gibt es Fresken und Gemälde aus dem 13. bis 18. Zwei verschiedene archäologische Ausgrabungen, eine vor und eine hinter der Kirche, haben jeweils eine Ziegelstraße aus dem 13. Jahrhundert und die Strukturen des Klosters aus dem späten 13. Jahrhundert, einen neuzeitlichen Brunnen und zehn Getreidesilos aus dem 16. und 17.