Øen Caprera er helt inkluderet i øhavet La Maddalena National Park, et hav-og terrestrisk beskyttet område af national og samfundsinteresse. Det har en takkede og urolig kystnære mønster. Den østlige del af kysten er særlig vanskelig at nå, fordi den er afskærmet af en lille kæde af lyserød granit. Kystområdet på den østlige side er meget stejlt, delvist dækket af enebær, mastiks træer og andre typiske eksemplarer af Middelhavsmakis. Mod vest giver skråningen plads til flade vidder, også af Middelhavsmakier, hvor der også er en stor fyrreskov. Øens vilde og pletfri natur bestemte i 1982 erklæringen om et naturreservat efterfulgt af dets optagelse i La Maddalena National Park. Den særlige naturalistiske og miljømæssige værdi har betydet, at det meste af den østlige kyststrækning, det såkaldte område A, er under en integreret beskyttelsesordning, der forbyder fiskeri foran Cala Coticcio. Dette forbud gælder også for havområdet øst for Punta Rossa og Isola Pecora. Om vinteren kan området stadig udforskes i bil, men om sommeren er det forbudt at passere der, medmindre med en tilladelse fra kommunen og Parkmyndigheden. Øen Caprera, såvel som for dens naturlige skønheder, er kendt, fordi den bevarer mindet om de seksogtyve år, som Giuseppe Garibaldi besluttede at tilbringe der: at besøge Garibaldi-kompendiet med graven og Det Hvide Hus, hans bopæl indtil hans død. Øen er også hjemsted for en sejlskole: caprera Sailing Center.