Το μουσείο περιλαμβάνει επιστημονικά όργανα φυσικής και αστρονομίας του πρώτου μισού του αιώνα, διατηρώντας ιδιαίτερα τις εφευρέσεις του Antonio Pacinotti από την Πίζα, ξεκινώντας από τη διάσημη μηχανή, τον πρώτο δυναμοκινητήρα συνεχούς ρεύματος, μέχρι τις ηλεκτρομαγνητικές συσκευές έλξης: όλες οι εφευρέσεις που αποτελούν μέρος του Ταμείου pacinotti. Το τμήμα αφιερωμένο στα όργανα είναι πολύ πλούσιο και ετερογενές. Τα κομμάτια της συλλογής χωρίζονται ανά τύπο: μηχανική, Αστρονομία, Ηλεκτρομαγνητισμός, μέτρηση χρόνου, οπτική, ακουστική, εργαλειομηχανές. Οι συλλογές του μουσείου συμπληρώνονται από σημαντικά αρχεία, όπως το ντοκιμαντέρ του Ταμείου Pacinotti, το αρχείο Pacinotti, το αρχείο Fermi-Persico και το αρχείο Riccardo Felici, που διατηρούνται από το Πανεπιστημιακό Σύστημα Βιβλιοθηκών. Το Μουσείο οργάνων φυσικής λειτουργεί σε συνεργασία με το επιστημονικό playroom: η διαδραστική-διδακτική έκθεση στοχεύει στην αναπαραγωγή, με πνεύμα Γαλιλαίας, των πειραμάτων που έχουν κάνει την ιστορία της επιστήμης και των επιστημόνων. Ένα μέρος όπου, παίζοντας και διασκεδάζοντας, τα παιδιά, οι έφηβοι και οι ενήλικες μαθαίνουν να γνωρίζουν και να κατανοούν την επιστήμη. Οι εκδηλώσεις που διοργανώνονται είναι μονοπάτια μεταξύ των παιχνιδιών Moderna πειράματα που εισάγουν τα πιο συναρπαστικά θέματα και πτυχές της κλασικής και σύγχρονης φυσικής, από το Galileo στον Αϊνστάιν μέχρι τις καινοτομίες του Secolo