השם פונדיצ'רי נגזר מהמילה הטמילית Puducheri המסמלת 'ההתיישבות החדשה'. זה היה יישוב צרפתי שכלל את פונדי, יאנם, קראיקל ומאהה. מדהימה היא העובדה שמחוזות שונים של פונדיצ'רי נופלים תחת מדינות שונות. הבירה פונדיצ'רי ממוקמת במדינת טמיל נאדו במרחק של כ-200 ק"מ מצ'נאי. בעוד שקראיקל היא גם חלק מטמיל נאדו, מאהה ממוקמת בקרלה, ויאנאם נמצאת באנדרה פראדש. ישנה השפעה חזקה של התרבות הצרפתית על העיירה פונדיצ'רי, במיוחד על הארכיטקטורה שלה, תוצאה של היחסים בני מאות השנים שקיים המקום הזה עם צרפת. כיום, פונדיצ'רי מפורסם יותר בגלל הקשר שלו עם סרי אורובינדו. סרי אורובינדו בחר במקום השליו וההרמוני הזה להתגורר בעשור השני של המאה הזו ונשאר שם עד מותו. מהפכן פוליטי לפני שהגיע לפונדיצ'רי, הוא הפך לאחד החכמים המפורסמים ביותר של העת המודרנית שהופקה על ידי הודו. לא הרבה ידוע על פונדיצ'רי לפני תחילת ההתיישבות הזרה. ישנן עדויות לאימפריות פאלבה, צ'ולה ו-ויג'יאנאגר ברחבי העיר. מה שמעניין הם השרידים של ארקמדו, העיר הארכיאולוגית המפורסמת עם נמל שדרכו התנהל סחר גדול עם האימפריה הרומית. דרך הנמל הזה נהגה הודו לייצא משי, תבלינים, אפילו ציפורים, אריות, פילים לאימפריה הרומית בתמורה לזהב." במאה ה-16, הפורטוגזים הגיעו לכאן לראשונה ולאחר מכן במאה שלאחר מכן הופיעו הדנים. בשנת 1673 הגיעו הצרפתים. עד אז היה פונדיצ'רי כפר אריגה ודייגים. הרובעים הצרפתיים התחילו לאורך הים והשתרעו דרומה, לאורך כל הים. העיר הגיחה לאט לאט עם המבצר במרכזה. העיירה מתכננים ניסו ליישם את מערכת הרשת הזו באופן שיטתי. זה הצריך בנייה מחדש של בתים רבים, בעיקר אלה של הטמיליאנים. זה גם הצריך יישום קפדני של תקנות. בסך הכל, לקח לצרפתים כמעט מאה שנה ליישם את התוכנית - זו של דפוס קונצנטרי קיים עם המבצר במרכז והשדרות המקיפות אותו. עם זאת, הוא התרחב מעבר לשדרה בשנים האחרונות. כיום, חלק מהאזורים הסמוכים, שהיו בעבר כפרים, נכללו בתוך t הוא גבולות העיר. בסביבות שנות ה-60 של המאה ה-20 הרסו הבריטים את העיר כולל המבצר. כשהצרפתים כבשו אותה מחדש, רוב המבנים שוחזרו אך לא המבצר. בחלק האחרון של המאה ה-18 ותחילת המאה ה-19, שוב נפל פונדיצ'רי לידיים בריטיות וכל פעילות הבנייה נעצרה. רוב הבניינים של ימינו עלו במאה ה-19, מה שסימן גם את הופעת אספקת המים בעיר וקשר הרכבת עם הודו הבריטית. עד המאה ה-20, העיר התרחבה לכלול כפרים שכנים רבים, אם כי מעט שינויים נעשו בעיר הפנימית. המושבה הצרפתית הזו הפכה לחלק מהאיחוד ההודי בתחילת שנות ה-50, כשהצרפתים ויתרו מרצונם על השליטה. כיום, טריטוריית האיחוד של פונדיצ'רי כוללת את שלוש המובלעות הצרפתיות האחרות של קראיקל (בטאמיל נאדו), מאהה (בקרלה) ויאנאם (באנדרה פראדש).