A Hongkongi Történeti Múzeumot 1975 júliusában hozták létre, amikor a városi múzeumot és művészeti galériát felosztották a Hongkongi Történeti Múzeum és a hongkongi Művészeti Múzeum között. A múzeum egyes gyűjteményei azonban a Városházán 1962-ben alapított Városi Múzeum és Művészeti Galéria gyűjteményéből származnak. 1983-ban a múzeumot áthelyezték a Kowloon Park ideiglenes szállására. 1998-ban áthelyezték a Chatham Road South, Tsim Sha Tsui jelenlegi telephelyére. A Hongkongi Történeti Múzeum állandó otthona, amelynek bruttó alapterülete 17 500 m2, egy új épületben található, E. Verner Johnson építészeti koncepciója alapján. Az új múzeum és a szomszédos Természettudományi Múzeum együttesen harmonikus megjelenésű és színvilágú múzeumi komplexumot alkot.
