ที่โบสถ์คืออุทิศให้องคิดของซานต้า Margherita,patroness ของ Cortona และ Franciscan tertiary และต่อมาวัฒนธรรมและจิตวิญญาณของกิจการของนัก Franciscans. ตอนการตายของเซนต์(เดือนกุมภาพันธ์ 22,1297 องมันถูกตัดสินใจที่จะสร้างโบสถ์ในของเธอให้เกียรติต่อไปโบราณโบสถ์ของซาน Basilio นั่น Margherita ตัวเองได้ถูกเรียกคืนหลังจากการเลือกมันเป็นสถานที่ของการสำนึกบาปและสวดภาวนาอีกหน่อย ใน 1304 ศักดิ์สิทธิ์ตึกแล้วสร้างขึ้นแต่มันกลับไปทำต่อยังตอจะ embellished สำคัญ frescoes ทั่วทั้ง Fourteenth ศตวรรษ เพียงไม่กี่ชิ้นส่วนของภาพวาดวังวนมาเพื่อพวกเราอยู่ใน Diocesan พิพิธภัณฑ์แต่หลักฐานของมันคือรักษาในรหัสของ seventeenth ศตวรรษที่เอกสารกับยี่สิบ-หนึ่ง watercolored ฉากองกำแพงภาพหายไปใน 1653 ตอนเนื่องจากพวกเขาน่าสงสารของรัฐของ Conservation พวกเขาเป็นล้างออกไป การวิเคราะห์ของเรารอดจากสถานการณ์ชิ้นส่วนทางไปเดทพวกเขาอยู่ 1335 และคุณลักษณะพวกเขาต้องห้องทำงานขอหนึ่งหรือทั้งสองของ Lorenzetti นพี่น้องกัน ใน 1385 โบสถ์นอให้ความไว้วางใจล้วนต้องกา Olivetan monks แทนใน 1389 โดยที่ช่างสังเกตตำแหน่งปลีกขวานที่ยังจัดของมันและขอต้อนรับแขก ในเดือนสิงหาคม 1927 มันสูงให้เกียรติศักดิ์ศรีของเล็กน้อย basilica.