Santa Maria del Coro-kirken i San Sebastian er en af de mest symbolske kirker i byen. Byggeriet, som resulterede i dens nuværende udseende, blev påbegyndt i 1743. Men Santa Maria-kirken var der allerede før den tid, og den var knyttet til byens befæstningsmure. Designet tilskrives Pedro Ignacio de Lizardi, selv om han igen blev påvirket af Miguel de Salezán og Domingo de Yarza. Den 27. april i ovennævnte år blev grundstenen til bygningen lagt, så mindehøjtideligheden på denne dag blev en af de mest populære begivenheder i byen og en helligdag for alle San Sebastians indbyggere. Arbejdet varede 21 år, indtil byggeriet var færdigt i 1764. Basilikaen er et imponerende barokværk fra det 18. århundrede i den gamle bydels travle Calle Mayor i den gamle bydel.
Dette kunstværk har en særlig interessant barokfacade i churriguereske nuancer med en stor skulptur af Sankt Sebastian Martyr og en altertavle dedikeret til Vor Frue af Koret, byens skytshelgen.
Ved siden af døbefonten er der en korsformet skulptur af Eduardo Chillida. Basilikaen blev bygget mellem 1743 og 1774 på fundamenterne af en tidligere kirke, der lå på samme sted. Hoveddøren løber i en lige linje til indgangen til Buen Pastor-katedralen. Folk, der er døbt i Santa María, er kendt som "josemaritarras" (bogstaveligt talt: "dem, der tilhører Jesus og Maria") og nævnes i hymnen til San Sebastián.