Seasann an séipéal ar bharr an chnoic i suíomh álainn. Ar an suíomh ar an eaglais i láthair ann a bhí séipéal beag tógtha ag an manach Camaldolese i XI haois agus atá tiomanta do Naomh Basil. An eaglais a bhí damáiste dóibh le linn an sac de Cortona de 1258 agus atógadh i 1288 trí Santa Margherita a bhí tiomnaithe do Naomh Basil, Naomh Egidio monacó agus Naomh Caitríona de Alexandria. Saint Margaret, i seomra ag an ar ais ar an séipéal beag mhair na bliana seo caite de a saol agus a fuair bás ann i 1297. Bhí sí a adhlacadh i Séipéal Naomh Basil. Díreach tar éis an bháis de Margherita an cortonesi, in aice leis an séipéal, a tógadh níos mó séipéal a dhearadh ag Giovanni Pisano agus i 1330 ar athraíodh a ionad an comhlacht ar an Naomh. An déag haois déag a thógáil fós ach amháin an d ' Ardaigh Fuinneog ar an facade, an túr clog agus an seachtrach ballaí an cór. I rith an naoú haois déag ag an séipéal leanúnach a bheith embellished le tábhachtach frescoes. An múrmhaisiú timthriall tagtha chun dúinn ach cúpla blúirí caomhnaithe i Músaem Deoise, ach tá fianaise ann go bhfuil sé caomhnaithe i gcód an seachtú haois déag go bhfuil na doiciméid le fiche watercolored radhairc ar an phictiúir bhalla caillte i 1653 nuair, mar gheall ar a n-staid droch-Chaomhnaithe, bhí siad a nite ar shiúl. An anailís ar an mhaireann blúirí mar thoradh ar chun dáta iad ar fud 1335 agus a tréith iad go dtí an cheardlann ar cheann amháin nó an dá de na Lorenzetti deartháireacha. I 1385 an eaglais, bhí a chuirtear de chúram chun an Olivetan manaigh, in ionad i 1389 ag an observant mionaoisigh a bhfuil fós cúram a ghlacadh de é agus fáilte a chur roimh chuairteoirí. An eaglais a bhí i ndiaidh a chlaochlú i an ré nua-aimseartha, a bhfuil an seachtú haois déag altars fós, ach an chuid is mó tábhachtach claochlú, ach imithe go hiomlán, bhí an ceann a bhí i lár an '700 John V, Rí na Portaingéile, a fuair cairde ó na Naomh. An eaglais i láthair é in áit mar thoradh ar an naoú-haois a athchóiriú, a chuirtear ar dtús chuig an ailtire Enrico Presenti, a in ionad an bunaidh corp amháin le basilica struchtúr, ansin leis an ailtire Mariano Falcini, a chríochnaigh an foirgneamh naofa gan taitneamhach an cortonese. Dá bhrí sin, sa bhliain 1896, an ailtire Giuseppe Castellucci coimisiúnaíodh chun athdhéan an facade, a bears i an tsúil an déag haois déag a d ' ardaigh fuinneog ar an sean scartáladh eaglais. I mí lúnasa 1927 bhí sé ardaithe go dtí an dínit Mion basilica. I séipéal an chroslann fhág tá an déag haois déag marmair séadchomhartha sepulchral de santa Margherita; an venerated iarsmaí chuid eile sa silver urn (1646) ag an Altóir Ard.
