Bazilica San Clemente al Laterano, care nu este la fel de turistică, povestește istoria Romei pe baza diferitelor straturi ale bisericii. Actuala biserică "San Clemente", dedicată papei Clement I, a fost construită pe o biserică din secolul al IV-lea, în secolul al XII-lea. Sub aceasta, au fost descoperite multe alte fundații romane. Actuala bazilică este una dintre multele din Roma și nu este motivul principal al vizitei dumneavoastră, însă la 20 de metri sub această biserică au fost găsite rămășițe ale unor case romane (500-27 î.Hr.). Se crede că aceste case au fost distruse de un incendiu de proporții în timpul domniei împăratului Nero și au fost folosite ulterior ca fundații.
Deasupra acestor fundații, a fost găsită o altă casă mare, construită în secolul I. Această casă a servit ca biserică secretă pentru papa Clement în acea perioadă, deoarece nu exista încă libertate de religie.
În secolul al IV-lea, când a fost acordată libertatea religioasă, deasupra bisericii secrete a fost construită o bazilică. Biserica a fost dedicată mormântului Sfântului Clement, cel de-al treilea succesor al lui Petru ca papă. Ceea ce face ca această bazilică să fie unică este cât de bogat a fost decorată de pictori și sculptori.
În 1084, o mare parte din biserică a fost distrusă în urma unor raiduri vikinge, după care Papa Pascal a pus să se construiască o nouă biserică deasupra celei vechi în secolul al XII-lea. Pentru a crea o fundație puternică, părți din vechea biserică au fost zidite și umplute.
Începând cu anul 1862, au fost efectuate numeroase săpături pentru a descoperi structuri antice, mozaicuri și fresce din biserica inferioară. Atunci când vizitați biserica, călătoriți prin diferitele straturi ale istoriei sale.