Fillimisht kjo kishë e ndërtuar në shekullin e 13-të dhe kushtuar Shën Nikollës, patronit të kishës së marinarëve, kishte qenë një ndërtim prej druri. Në fund të shekullit të 13-të u mor vendimi për të ndërtuar një kishë prej guri. Oude Kerk kishte në fillim formën e një kishe sallë romake, kisha e parë e këtij lloji në Holandë. Në vitin 1306, kisha është shenjtëruar nga peshkopi katolik i Utrehtit, Guy van Avesnes van Henegouwen, varrin e skalitur të të cilit mund ta shihni ende në Kupolën në Utrecht.Në vitin 1340, Oude Kerk ishte zgjeruar në një strukturë jashtëzakonisht të madhe për një qytet, i cili në atë kohë kishte tre deri në katër mijë banorë. Çuditërisht, zjarret e mëdha të Amsterdamit në 1421 dhe 1452, të cilat shkatërruan qytetin e ndërtuar atëherë kryesisht me dru, nuk e dëmtuan Oude Kerk.Në shekujt 14 dhe 15, kisha ka qenë kisha famullitare e Amsterdamit dhe për shkak se qyteti u rrit me shpejtësi, Oude Kerk është rindërtuar dhe zgjeruar disa herë. Në vitin 1565 Oude Kerk mori kullën e kambanës dhe që atëherë arkitektura e saj nuk ndryshoi shumë.
