Táto nie príliš turistická bazilika San Clemente al Laterano rozpráva históriu Ríma na základe rôznych vrstiev kostola. Súčasný kostol "San Clemente", zasvätený pápežovi Klementovi I., bol postavený na kostole zo 4. storočia v priebehu 12. storočia. Pod ním sa našli mnohé ďalšie rímske základy. Súčasná bazilika je jednou z mnohých v Ríme a nie je hlavným dôvodom vašej návštevy, ale 20 metrov pod týmto kostolom sa našli zvyšky rímskych domov (500 - 27 pred n. l.). Predpokladá sa, že domy boli zničené veľkým požiarom počas vlády cisára Nera a neskôr boli použité ako základy.
Na vrchole týchto základov sa našiel ďalší veľký dom, ktorý bol postavený v 1. storočí. Tento dom slúžil ako tajný kostol pre pápeža Klementa v tom čase, keďže ešte neexistovala náboženská sloboda.
V 4. storočí, keď bola udelená náboženská sloboda, bola na vrchole tajného kostola postavená bazilika. Kostol bol zasvätený hrobu svätého Klementa, tretieho nástupcu Petra vo funkcii pápeža. Jedinečnosť tejto baziliky spočíva v tom, ako bohato ju vyzdobili maliari a sochári.
V roku 1084 bola veľká časť kostola zničená pri nájazdoch Vikingov, po ktorých dal pápež Paschal v 12. storočí postaviť na mieste starého kostola nový. Aby sa vytvorili pevné základy, časti starého kostola boli zamurované a zasypané.
Od roku 1862 sa uskutočnilo mnoho vykopávok, ktoré odhalili starobylé štruktúry, mozaiky a fresky dolného kostola. Pri návšteve kostola putujete rôznymi vrstvami jeho histórie.