Ben Ezra sinagoga tiek uzskatīta par vecāko sinagogu pasaulē un arī garāko kalpošanu. Sinagoga ir stāvējusi uz vietas kopš vismaz 9. gadsimta un kalpoja kā pielūgsmes vieta Ēģiptes ebreju kopienai līdz masveida izceļošanai uz Izraēlu 1950. gados. visā tās vēsturē sinagoga ir pārbūvēta.
Sākotnējā ēka tika nojaukta ap 1012. gadu pēc tam, kad Fatimid kalifs Al-Hakim bi-Amr Allah pavēlēja iznīcināt visas ebreju un kristiešu dievkalpojumu vietas. Sinagoga tika pārbūvēta starp 1025-1040 un pēc tam pilnībā pārbūvēta vēl vienu reizi 1890s. Like gandrīz visi Ēģiptes sinagogām, Ben Ezra ir tūristu piesaisti un muzejs šodien.