Biserica San Matteo, pe care Doria o construise ca capelă nobilă, are vedere la mica Piazza San Matteo din Genova.Odată cu renovarea din secolul al XVI-lea, interiorul, cu trei nave, și-a pierdut aproape complet caracterul gotic original, din care rămân doar cele patru arcade ogivale de la baza cupolei, susținute de doi stâlpi spre presbiteriu și două coloane spre Nave. Nava centrală este separată de cele laterale prin coloane. Corul, altarul cu trofee, cele două amvoane și urnele presbiteriului sunt atribuite lui Silvio Cosini și Giovanni Angelo Montorsoli. Toate decorațiile prezente sunt atribuite renovării din secolul al XVI-lea. În bolta naosului se află Miracolul Dragonului etiopian De Luca Cambiaso și vocația San Matteo de Giovanni Battista Castello. Pe altarul din dreapta maiorului este așezată o pictură a Sfintei Familii cu Sfânta Ana de Bernardo Castello, din secolul al XVI-lea; în stânga, Hristos printre sfinți și donatori de Andrea Semino. Pe pereții presbiteriului se află arcadele de marmură ale sfinților Pelagius și Maximus, patronii Novigradului, din Istria, ale căror moaște ar fi fost transportate la Genova de Gaspare Spinola în 1381. Sub altarul înalt se păstrează o sabie aparținând "tatălui Patriei" Andrea Doria, care i-a fost dată conform tradiției de Papa Paul al III-lea. Într-o nișă în naos este o declarație a lui Isus în mormânt, din lemn policrom sculptura de Anton Maria Maragliano, în timp ce statuile în nișe de absidă (Mila, inspirat de opera lui michelangelo, David, Ieremia, Ioan Botezătorul, și St. Andrew) sunt opera Montorsoli, care, de asemenea, în cripta de sub cor, cu timpul din stuc aurit, care este accesat printr-o scara de marmură, care adăpostește mormântul lui Andrea Doria, de asemenea, activitatea de acelasi artist.