Byodo i templet är ett slående exempel på buddhistisk ren mark (Jodo) arkitektur. Tillsammans med sin trädgård representerar templet det rena Landparadiset och var inflytelserikt på senare tempelbyggnad. Byodoin byggdes ursprungligen i 998 som en landsbygd retreat villa för den mäktiga politiker Fujiwara no Michinaga, inte som ett tempel. Michinagas son förvandlade Byodoin till ett tempel och beordrade byggandet av sin mest spektakulära funktion, Phoenix Hall. Även om byggnaden fick ett annat officiellt namn, nästan omedelbart efter dess konstruktion i 1053, var det smeknamnet Hoodo (" Phoenix Hall ") på grund av sin form och de två phoenix statyer på taket. Hallen är nu med på baksidan av den japanska tio yen mynt. Byodoins unika skatthus byggs mestadels under jord för att inte distrahera från Phoenix Hall.