ARQUA là một tài liệu tham khảo cần thiết để khám phá di sản dưới nước của Tây Ban Nha ở hai khu vực lớn. Phần đầu tiên, "Di sản văn hóa dưới nước", tập trung vào việc giải thích phương pháp được sử dụng trong các cuộc khai quật dưới nước.Hai tòa nhà có cấu trúc hiện đại ấn tượng, được liên kết dưới mặt đất và được thiết kế để tạo ra hiệu ứng dưới nước. Bên trong, không gian đáng chú ý này chứa các cuộc triển lãm giải thích quá trình khảo cổ học dưới nước hấp dẫn và một bộ sưu tập hiện vật chiết trung liên quan đến các con tàu lịch sử được sử dụng trong thương mại hàng hải Địa Trung Hải cổ đại.Một tính năng thú vị là bản sao của một trong những con tàu Phoenicia (thế kỷ thứ 7 sau Công nguyên), được tìm thấy ở Mazarrón. Khu vực khác, được gọi là "Mare Hibericum", mời du khách khám phá Bán đảo Iberia thông qua lịch sử thương mại năng động của Địa Trung Hải, từ thời cổ đại đến thế kỷ 19.Ngoài ra còn có ngà voi từ thời Phoenicia, được phát hiện tại địa điểm Bajo de la Campana. Đây là bảo tàng khảo cổ học dưới nước đầu tiên ở Tây Ban Nha.Một số tính năng tốt nhất là các mặt cắt ngang được tái tạo của các con tàu cho thấy cách các con tàu được chế tạo và cách hàng hóa được xếp. Có một số mô hình thu nhỏ rất chi tiết thể hiện cảnh hoạt động của cảng và mô hình tàu thuyền từ các thời đại khác nhau.Phần trưng bày cuối cùng là về tàu khu trục nhỏ Nuestra Senora de las Mercedes của Tây Ban Nha, bị chìm ngoài khơi Bồ Đào Nha vào năm 1804. Xác tàu đã làm nảy sinh một vụ kiện pháp lý quan trọng giữa chính phủ Tây Ban Nha và công ty săn tìm kho báu Odyssy Marine Exploration, dẫn đến việc trả lại khoảng 500 triệu đô la giá trị của các cổ vật bị cướp bóc ở Tây Ban Nha, bao gồm vô số đồng xu truyền thống của Tây Ban Nha được trưng bày tại bảo tàng.