Caprera szigete teljes egészében a La Maddalena Nemzeti Park szigetcsoportjába tartozik, amely nemzeti és közösségi érdekű tengeri és szárazföldi védett terület. Szaggatott és hullámzó parti mintázata van. A part keleti részét különösen nehéz elérni, mert egy kis rózsaszín gránit lánc árnyékolja. A keleti oldal partvidéke nagyon meredek, részben borókák, Masztixfák és a mediterrán maquis más tipikus példányai borítják. Nyugat felé a lejtő sík kiterjedésű, szintén mediterrán maquis, ahol hatalmas fenyőerdő is található. A sziget vad és makulátlan természete 1982-ben meghatározta a Természetvédelmi Terület nyilvánítását, majd a La Maddalena Nemzeti Parkba való felvételét. A különleges természeti és környezeti érték azt jelentette, hogy a keleti partszakasz nagy része, az úgynevezett A Zóna integrált védelmi rendszer alatt áll, amely megtiltja a halászatot Cala Coticcio előtt. Ez a tilalom a Punta Rossától és Isola Pecorától keletre fekvő tengeri területre is vonatkozik. Télen a terület autóval még bejárható, de nyáron tilos oda haladni, kivéve, ha erre az önkormányzat és a Parkhatóság engedélyt ad. Caprera szigete, valamint természeti szépségei miatt ismert, mert megőrzi annak a huszonhat évnek az emlékét, amelyet Giuseppe Garibaldi úgy döntött, hogy ott tölt: meglátogatja a Garibaldi kompendiumot a sírral és a Fehér Ház, lakóhelye haláláig. A szigeten egy vitorlás iskola is található: a caprera Vitorlás Központ.
