La St. Nikolai-Kirche, (Chiesa di San Nicola) è la più antica chiesa di Berlino. L'area intorno alla chiesa è conosciuta come il "quartiere di Nicola", ed è una zona di edifici medievali restaurati. La chiesa è stata costruita tra il 1220 e il 1230, ed è quindi, insieme alla Chiesa di Nostra Signora in Alexanderplatz non lontano, la più antica chiesa di Berlino.
Originariamente una chiesa cattolica romana, la Chiesa di San Nicola divenne una chiesa luterana dopo la Riforma protestante nell'Elettorato di Brandeburgo nel 1539. Nel XVII secolo, l'importante scrittore di inni Paul Gerhardt era il ministro di questa chiesa, e il compositore Johann Crueger era il direttore musicale. Il prominente teologo luterano Provost Philipp Jacob Spener fu il ministro dal 1691 al 1705. Dal 1913 al 1923 il ministro della chiesa di San Nicola fu Wilhelm Wessel, il cui figlio Horst Wessel divenne poi famoso come nazista: la famiglia viveva nella vicina Jüdenstraße.
Il giorno della Riforma nel 1938 l'edificio della chiesa servì la sua congregazione per l'ultima volta. Poi l'edificio, la struttura più antica di Berlino propriamente detta, fu ceduto al governo, per essere utilizzato come sala da concerto e museo ecclesiastico. Il numero di parrocchiani si era ridotto a causa della commercializzazione sempre più intensa del centro della città, con edifici residenziali sostituiti da uffici e negozi. La congregazione si è poi fusa con quella della Chiesa di Nostra Signora.
Durante la seconda guerra mondiale la chiesa di San Nicola perse, a causa dei bombardamenti degli alleati, le cime delle sue torri e il tetto. Nel 1949 crollarono tutte le volte e i pilastri settentrionali. Le rovine si trovavano a Berlino Est, e solo nel 1981 le autorità della Repubblica Democratica Tedesca Orientale autorizzarono la ricostruzione della chiesa, utilizzando vecchi disegni e progetti. La chiesa di San Nicola come si vede oggi è in gran parte una ricostruzione. Oggi la chiesa serve di nuovo principalmente come museo e occasionalmente come sede di concerti, amministrata dalla Stiftung Stadtmuseum Berlin (Landesmuseum für Kultur und Geschichte Berlins). È rinomata per la sua acustica e la chiesa ricostruita è stata dotata di una bella serie di 41 campane.
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