Crkva je nastala pripajanjem nekoliko arhitektonskih objekata: dvostruke stube na pročelju skrivaju ulaz u temeljnu crkvu Utjehe u Carbonari; središnji portal vodi do kapele Santa Monica, onaj lijevo do bočnog ulaza u crkvu San Giovanni.Jedna je od najbogatijih crkava umjetninama u gradu.Prekrasna crkva sagrađena je zahvaljujući plemiću Gualtieru Galeoti koji je između 1339. i 1343. darovao zemljište izvan gradskih zidina zvano "ad carbonetum" ocima augustincima, dopuštajući im da osnuju samostan i crkvu (Via Carbonara zove se sve danas kako-tako jer je u srednjem vijeku to bilo mjesto za skupljanje otpada izvan gradskih zidina).Dolaskom kralja Ladislava od Durazza u Napulj, započela je potpuna obnova crkve, koja je uglavnom poprimila današnji izgled osim nekih preinaka i dogradnji u sljedećim stoljećima. Važan ulaz čini nam da shvatimo važnost crkve: pristupa joj se, zapravo, preko monumentalnog stubišta koje je u 18. stoljeću sagradio Ferdinando Sanfelice koji je stvorio stubište s dvostrukom rampom kako bi riješio problem neravnina između ulice i raznih ulaza. zgrada koje tvore složenu arhitektonsku strukturu.Zapravo, cijeli kompleks uključuje još dvije vjerske građevine, a to su crkva Santa Monica i crkva Consolazione u Carbonari; u blizini se nalazi još jedna crkva, ona Pietatella u Carbonari. Unutar monumentalne crkve San Giovanni a Carbonara, izgrađene na pravokutnom tlocrtu, ističe se mauzolej kralja Ladislava, sagrađen između 1414. i 1428. godine, prepun alegorijskih figura.Iza spomenika je Cappella Caracciolo del Sole, sa spomenikom Sergiannija Caracciola, velikog senešala i ljubavnika kraljice Giovanne. Ostale kapele, kao što su one Miroballo, Somma i Caracciolo di Vico pune su kipova i važnih grobnih spomenika. Na zidovima su freske iz Giottove škole koje predstavljaju scene monaškog života i rođenja Djevice. Desno od prezbiterija su kapela Caracciolo di Vico, sakristija, oltar Madonna delle Grazie i nadgrobni spomenik Miroballo.U crkvi je bilo i šesnaest djela Giorgia Vasarija, nastalih za sakristiju crkve. Slike na drvu naručio je 1545. red augustinaca, a izradio ih je Vasari 1546., uz suradnju Cristofana Gherardija, jednog od njegovih najboljih suradnika. Bilo je 16 slika na drvu, koje su ukrašavale vrata ormara u sakristiji, a prikazivale su priče iz Staroga zavjeta i epizode iz života Krstitelja. Prekrasna djela prošla su rigoroznu restauraciju i također su izložena u Capodimonteu.
