Crkva je rezultat pripajanja nekoliko arhitektonskih objekata: dvostruko stepenište na fasadi skriva ulaz u temeljnu crkvu Utjehe u Karbonari; središnji portal vodi do kapele Santa Monica, onaj s lijeve strane do sporednog ulaza u crkvu San Giovanni.Jedna je od najbogatijih crkava umjetničkim djelima u gradu.Prekrasna crkva izgrađena je zahvaljujući plemiću Gualtieru Galeoti koji je između 1339. i 1343. godine darovao zemljište izvan gradskih zidina pod nazivom "ad carbonetum" ocima augustincima, omogućivši im da osnuju samostan i crkvu (Via Carbonara se zove sve danas tako-tako jer je u srednjem vijeku bilo mjesto za sakupljanje otpada izvan gradskih zidina).Dolaskom kralja Ladislava od Durazza u Napulj, započela je potpuna obnova crkve, koja je u velikoj mjeri poprimila današnji izgled osim nekih preinaka i dogradnji u narednim stoljećima. Važan ulaz nam daje da shvatimo važnost crkve: do nje se, zapravo, dolazi kroz monumentalno stepenište koje je u 18. stoljeću izgradio Ferdinando Sanfelice koji je napravio stepenište s dvostrukom rampom kako bi riješio problem neravnina između ulice i različitih ulaza. objekata koji čine složenu arhitektonsku strukturu.Zapravo, cijeli kompleks uključuje još dva vjerska objekta, a to su crkva Santa Monica i crkva Consolazione u Carbonari; u blizini se nalazi još jedna crkva, ona Pietatella u Carbonari. Unutar monumentalne crkve San Giovanni a Carbonara, izgrađene na pravougaonom planu, ističe se mauzolej kralja Ladislaa, izgrađen između 1414. i 1428. godine i prepun alegorijskih likova.Iza spomenika je Cappella Caracciolo del Sole, sa spomenikom Sergiannija Caracciola, velikog senešala i ljubavnika kraljice Giovanne. Druge kapele, kao što su one Miroballo, Somma i Caracciolo di Vico, pune su statua i važnih grobnih spomenika. Na zidovima su freske iz Giotto škole koje predstavljaju prizore monaškog života i rođenja Bogorodice. Desno od prezbiterija su kapela Caracciolo di Vico, sakristija, oltar Madonne delle Grazie i pogrebni spomenik Miroballo.U crkvi se nalazilo i šesnaest djela Giorgia Vasarija, nastalih za sakristiju crkve. Slike na drvetu naručio je Red Augustinaca 1545. godine, a izradio ih je Vasari 1546. godine, uz suradnju Cristofana Gherardija, jednog od njegovih najboljih saradnika. Bilo je 16 slika na drvetu, koje su ukrašavale vrata ormara u sakristiji sa prikazom priča iz Starog zavjeta i epizoda iz života Krstitelja. Prekrasni radovi su podvrgnuti rigoroznoj restauraciji i također su izloženi u Capodimonteu.
