De Crypte van San Magno werd gebouwd door bisschop Pietro da Salerno op hetzelfde moment als de kathedraal tussen 1072 en 1104. Het moest dienen als een schatkist voor het behoud van alles dat een kathedraal heeft de meest heilige: de relikwieën van de Heiligen. De kamer heeft drie gangen ten opzichte van die van de bovenste kerk en drie apses. De twaalf kolommen identificeren eenentwintig keer dat, met hun respectieve muren, worden versierd door een picturale cyclus van uitzonderlijke schoonheid die het verhaal vertelt van de redding van de mens, van zijn schepping tot het einde der tijden. De fresco ' s worden toegeschreven aan drie workshops van anonieme kunstenaars die bekend staan als eerste meester van Anagni of meester van vertalingen, tweede meester van Anagni of meester Ornatist en derde meester van Anagni. Om stylistische en historische redenen worden de fresco ' s van de Crypte geplaatst tussen het einde van de XII eeuw en de eerste helft van de XIII eeuw.
