Det arkæologiske museum i Pythagorion huser omkring 3.000 genstande, der blev fundet ved udgravninger i den antikke by Samos og ved andre udgravninger rundt om på øen. Disse udstillingsgenstande viser øens historiske udvikling fra det 5. årtusinde f.Kr. til det 7. århundrede e.Kr. og viser Samos' politiske betydning i oldtiden.
Museets csamling af "nekrodeipna" skiller sig ud som en unik skat. Det er relieffer, der skildrer begravelsesbanketter og giver indsigt i oldtidens begravelsesskikke og tro. En bred vifte af keramik, der stammer fra det 9. århundrede f.Kr. til det 2. århundrede f.Kr. beriger museets tilbud yderligere.
Blandt de udstillinger, man ikke må gå glip af, er:
En siddende marmorstatue af Aeaces, der stammer fra omkring 540 f.Kr. Inskriptionen afslører, at den blev dedikeret til gudinden Hera af Aeaces, Polykrates' far. Det er interessant, at den blev finansieret af den rigdom, som Aeaces fik fra pirateri.
En storslået marmorsarkofag, der er udformet, så den ligner en tempellignende struktur, og som stammer fra anden halvdel af det 6. århundrede f.Kr.
En lille poros-gravstele prydet med en palmetfinial og indskrevet med ordene "DIAGORO TO GDILO," dateret til 530 f.Kr.
En anden gravstele i marmor med en palmetfinial, fundet i Chora og dateret til 500/490 f.Kr.
En overdimensioneret marmorstatue af den romerske kejser Trajan, der er imponerende 2,71 meter høj.
Detaljerede marmorportrætter af de romerske kejsere Augustus og Claudius, der måler henholdsvis 0,49 meter og 0,53 meter i højden.
Museet er bekvemt placeret ca. 300 meter fra havnefronten.
>p