La seu central està Medici arsenals, en la lungarno pisano, una sèrie de coberts utilitzats com arsenals per a la construcció i manteniment de les galeres dels Cavallers de Santo Stefano de cavalleria de cos, utilitzat per a la naval de defensa contra l'amenaça Sarraïna. A la façana de l'arsenal, de fet, un nombre d'inscripcions commemorar les principals victòries dels Cavallers contra els Sarraïns. Els arsenals aviat va entrar en desús i van ser ocupades per les estructures militars i estables. Fins a la primera post-guerra que va acollir la cria de cavalls centre de l'Exèrcit italià; part de la stazzi i les estructures utilitzades al refugi de cavalls s'han mantingut en l'entorn, per preservar la memòria d'aquesta important etapa històrica. 1000 anys d'història llarga de comerç i mariners, de rutes i de naufragis, de la navegació i de la vida a bord i la història de la ciutat de Pisa. 800 exposicions exposat en 8 seccions temàtiques, dins les quals les seccions del museu del vent, en una seqüència lògica. La ciutat entre Dos Rius, la Terra i les aigües, la fúria de les aigües, Navalia, els vaixells, els oficis, la navegació, la vida a bord.
